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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000617`

染色体: Chr02 坐标: 8986416-8989394 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000617`
名称	SmilChr02G000617
描述	probable pyruvate, phosphate dikinase regulatory protein, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	8986416 - 8989394 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012945`
GeneID	`131012945`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012945`
原始查询	`SmilChr02G000617`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pyruvate, phosphate dikinase regulatory protein, chloroplastic
产物	probable pyruvate%2C phosphate dikinase regulatory protein%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G21210` (RP1) PPDK regulatory protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827869] identity=57.4; qcov=1.02; evalue=1.77e-158; confidence=high
Rice	`Os07g0530600` (PDRP1) - identity=61.2; qcov=0.96; evalue=9.75e-164; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016772 (transferase activity, transferring phosphorus-containing groups)
KEGG	-
Pfam	PF03618 (Kinase-PPPase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012945

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057796909.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796909.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057796909.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796909.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796909.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:8986882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B26,B29,B97,C5
`Chr2:8986886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B53,B64
`Chr2:8986979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:8987003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:8987145`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B5
`Chr2:8987145`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B5
`Chr2:8987153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:8987242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr2:8988790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr2:8988857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,A8,B25,B68,B97
`Chr2:8988875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:8988940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796909.1

403 aa

202

403

Kinase-PPPase

PF03618 Kinase-PPPase 115-384 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796909.1`	Pfam	`PF03618`	Kinase-PPPase	Family	115	384	3.1e-85	286.6	Kinase/pyrophosphorylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940926.1
ACCTCACAAGTGTGGGTATTAAATTACAATTAACCTTTAAAAAATCAATATTTTTTTGACATTAAGCTGTATTTTCCCAAAAATATTAAAATAAAAAAGAAAAAGAGATTTATAGGATCTATCATGTCGAGACGGAGAGAAGAGAGTCAGAAATCTCAAGGACTCAACGCTGCCACGTAAAACCCCGATGTTTCAGTTCTCCGACACCAACCCGAAATAGCCGGAAAATCCAAAGGATAAATCCCCCAAAACCGCAATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012945
ATGATTTCCACCTCAACCTTATCCTTGTCGAACATCCCGCCCACGCCGTCGCCGGCCGCCATCTCCGACCTAAAACCGATCTCCCCGACCGCCTCCCCCGACCCTCCGTCTTCGCCGGATTCTCTCTCGCGCCGCATCAAATCGAGCCCGCAGCTGAACCGTTGGTCCAGGGCTCGCGCCGTACGGTCCGGCCGGAAATTGAGCCGCCCGGTGGAGAGATCTGCCGATGAGATGACTGCCTCCGACTCTCCGGCGAGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796909.1
MISTSTLSLSNIPPTPSPAAISDLKPISPTASPDPPSSPDSLSRRIKSSPQLNRWSRARAVRSGRKLSRPVERSADEMTASDSPARLVSDGGGSELSPRNDGGRDGEPLAAAKSIYMVSDGTGWTVEHSVTAALGQFEHCLVDRVCPISTHLFSGIDDVDRLMEVIAQAAKEGAMVVYTLADPSIAESARQACVLWGVTSLDVLSPITEAVASHLGVSPSGLPRWAPGRTTPLGEDYFRRIEAIEFTIKQDDGALPRNLH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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