当前解析结果
SmilChr02G000621| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000621 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000621 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000621 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 9172242 - 9174883 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131012958 |
|---|---|
| GeneID | 131012958 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012958 |
| 原始查询 | SmilChr02G000621 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0190800; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os08g0190800; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G61780 (AT1G61780)postsynaptic protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842475] identity=86.7; qcov=1.02; evalue=4.94e-58; confidence=high |
| Rice | Os08g0190800- identity=89.6; qcov=1; evalue=3.11e-60; confidence=high |
| GO | GO:0008017 (microtubule binding); GO:0031122 (cytoplasmic microtubule organization) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF10235 (Cript) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012958 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057796929.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057796929.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057796929.1 |
| 4 | Nucleolar fibrillar center | Nucleolar fibrillar center | 0.20000 | XP_057796929.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057796929.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057796929.1PF10235
Cript 12-95 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057796929.1 |
Pfam | PF10235 |
Cript | Family | 12 | 95 | 1e-35 | 123.0 | Microtubule-associated protein CRIPT |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。