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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000632`

染色体: Chr02 坐标: 9512418-9513257 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000632`
名称	SmilChr02G000632
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00310-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	9512418 - 9513257 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007968`
GeneID	`131007968`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007968`
原始查询	`SmilChr02G000632`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=28.4; qcov=0.882; evalue=8.58e-17; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=26.9; qcov=1.02; evalue=1.86e-25; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007968

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790858.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790858.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790858.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790858.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790858.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:9512424`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B130,C59
`Chr2:9512424`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B130,C59
`Chr2:9512426`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C12,C34
`Chr2:9512426`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C12,C34
`Chr2:9512433`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C12,C34
`Chr2:9512433`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C12,C34
`Chr2:9512435`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A10,B14,B18,B3,B36,B47,B83,C59,C60
`Chr2:9512444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C34
`Chr2:9512471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B60,C12,C20,C34
`Chr2:9512476`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B55,B60,C12,C20,C34
`Chr2:9512476`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B55,B60,C12,C20,C34
`Chr2:9512484`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B55,B60,C12,C20,C34

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934875.1
ATGGAGTGGGCCTTTTTGAACGACAAGATTAAAAGCAAGATTAATGGGTGGAAGAAGCGGAAAATCTCCTTCACTGGAAGAGCCACTCTTATCCGGTCTGTTTTGCTTTCTATCCCGATCTATCATCTCTCTTTTTCCAAATTTCCTAAGTGTGTCGTCGATGAAATTCAGTCTTATTTTAGTAAGTTCCTCTGGGGTGGGGGCTTGGAGGATAGGAAAATCCATTGGGTGAAGTGGGATGATTTGTGTGTTGGTTATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007968
ATGGAGTGGGCCTTTTTGAACGACAAGATTAAAAGCAAGATTAATGGGTGGAAGAAGCGGAAAATCTCCTTCACTGGAAGAGCCACTCTTATCCGGTCTGTTTTGCTTTCTATCCCGATCTATCATCTCTCTTTTTCCAAATTTCCTAAGTGTGTCGTCGATGAAATTCAGTCTTATTTTAGTAAGTTCCTCTGGGGTGGGGGCTTGGAGGATAGGAAAATCCATTGGGTGAAGTGGGATGATTTGTGTGTTGGTTATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790858.1
MEWAFLNDKIKSKINGWKKRKISFTGRATLIRSVLLSIPIYHLSFSKFPKCVVDEIQSYFSKFLWGGGLEDRKIHWVKWDDLCVGYGLGGLNFKNLNWFNTTLMAKWIWRFLVDKHLLWAKAVRACHGEFVWENGGLDDTNGKITQIGWWKIVLGISRGDDGKWLRDNVEVVLGEGDSLSFWHDWWIGEGKLSEKFPRLFRISNNKHGTVKSMGIWVEGTWRWNLEWSREPRGREHDQIQSLISIINCCVLRVDKRDGWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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