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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000643`

染色体: Chr02 坐标: 9721651-9724282 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000643`
名称	SmilChr02G000643
描述	uncharacterized SmilChr02G000643
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	9721651 - 9724282 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007971`
GeneID	`131007971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007971`
原始查询	`SmilChr02G000643`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=29.5; qcov=0.384; evalue=3.88e-23; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=28.5; qcov=0.673; evalue=1.13e-47; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057790861.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790861.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790861.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790861.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790861.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:9721652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B6,C50,C87
`Chr2:9721655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B93,C5,D4
`Chr2:9721674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B9,B93,C35
`Chr2:9721682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr2:9721683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B92,C66
`Chr2:9721688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,A8,B92,C66
`Chr2:9721707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B44
`Chr2:9721709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C20
`Chr2:9721715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C65
`Chr2:9721728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A5,B130,B15,B49,B61,B63,B97,C19,C26,C33
`Chr2:9721847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B41,B89,C31,C75
`Chr2:9721851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790861.1

698 aa

349

698

RVT_1

PF00078 RVT_1 315-450 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790861.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	315	450	1.6e-19	71.3	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934878.1
ATGTGGACGGGGAATGATATTGAGGGATGGAGTTTTTTTGTGGTTAAGGAGAAACTGAAGAAACTGAAAGAGGCCTTGAAGGTGTGGAATCGCTCTTCTTTTGGAGAGATTGGCAACAAAATTCATGAACTTCAGAAGGAACTTCAAGATAAGGATAAGGAGGACGAACAGAGTTGTCTTGGAGAATCGGATATTATCAGGAGAAACGAGATTCAAGCTCAACTCTCTCTTCAACTCAAGAATAAACAGATGGTGTTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007971
ATGTGGACGGGGAATGATATTGAGGGATGGAGTTTTTTTGTGGTTAAGGAGAAACTGAAGAAACTGAAAGAGGCCTTGAAGGTGTGGAATCGCTCTTCTTTTGGAGAGATTGGCAACAAAATTCATGAACTTCAGAAGGAACTTCAAGATAAGGATAAGGAGGACGAACAGAGTTGTCTTGGAGAATCGGATATTATCAGGAGAAACGAGATTCAAGCTCAACTCTCTCTTCAACTCAAGAATAAACAGATGGTGTTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790861.1
MWTGNDIEGWSFFVVKEKLKKLKEALKVWNRSSFGEIGNKIHELQKELQDKDKEDEQSCLGESDIIRRNEIQAQLSLQLKNKQMVLQQKAKLKWLKEGDINSGFFHRAIRGRRLKNDIGELFFDNTWISKPVEVKARVRNHFKNFFKRKERQMPDLPLDFMRRKLSNEERQWLIRDFDFDEIKEAVWSCCGDKSPGPDGFNFTFWRAAWHIVKEDLLQVLKEFHASGKIPKGGNVSFIVLIPKKEGAGTLDEFRPILLIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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