当前解析结果
SmilChr02G000646| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000646 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000646 |
| 描述 | cytochrome P450 77A3 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 9763684 - 9767184 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131013376 |
|---|---|
| GeneID | 131013376 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013376 |
| 原始查询 | SmilChr02G000646 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cytochrome P450 77A3 |
| 产物 | cytochrome P450 77A3 |
| Arabidopsis | AT1G11600 (CYP77B1)cytochrome P450, family 77, subfamily B, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837704] identity=68.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os06g0680700- identity=62.4; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016709 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen); GO:0020037 (heme binding) |
| KEGG | smil00073 (Cutin, suberine and wax biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00067 (p450) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013376 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057797425.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057797425.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057797425.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797425.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057797425.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:9763789 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr2:9763805 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr2:9763841 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr2:9763972 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:9764037 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B107 |
Chr2:9764037 |
CG |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr2:9764038 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 25 | A19,B117,B121,B124,B49,B60,B64,B7,B79,B83,B94,B95,C12,C14,C19,C20,C22,C41,C48,C52,C53,C64,C66,C71,D10 |
Chr2:9764041 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 24 | A19,B117,B121,B124,B49,B60,B64,B7,B79,B83,B94,B95,C14,C19,C20,C22,C41,C48,C52,C53,C64,C66,C71,D10 |
Chr2:9764048 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A9,C12 |
Chr2:9764097 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B121,B76,C45,C80 |
Chr2:9764163 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C33 |
Chr2:9764196 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B121,C45,C80 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057797425.1PF00067
p450 35-496 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057797425.1 |
Pfam | PF00067 |
p450 | Domain | 35 | 496 | 2.5e-92 | 310.8 | Cytochrome P450 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。