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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000652`

染色体: Chr02 坐标: 9870651-9875685 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000652`
名称	SmilChr02G000652
描述	tobamovirus multiplication protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	9870651 - 9875685 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013668`
GeneID	`131013668`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013668`
原始查询	`SmilChr02G000652`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tobamovirus multiplication protein 1-like
产物	tobamovirus multiplication protein 1-like
Arabidopsis	`AT4G21790` (TOM1) tobamovirus multiplication 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828267] identity=76.6; qcov=0.986; evalue=1.34e-162; confidence=high
Rice	`Os07g0102400` - identity=74.4; qcov=0.931; evalue=1.45e-142; confidence=high
GO	GO:0009705 (plant-type vacuole membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06454 (THH1_TOM1-3_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013668

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057797783.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057797783.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057797783.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057797783.1`
5	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.20000	`XP_057797783.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:9872054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C59
`Chr2:9872218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr2:9872998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B69,B75,B78
`Chr2:9873727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:9875289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr2:9875296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C85
`Chr2:9875319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797783.1

290 aa

145

290

THH1_TOM1-3_dom

PF06454 THH1_TOM1-3_dom 20-290 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797783.1`	Pfam	`PF06454`	THH1_TOM1-3_dom	Domain	20	290	2e-135	451.3	THH1/TOM1/TOM3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941800.1
ATCGGGGAAAATTCTAGAGGACCACGTAGAGATTGATCCTTTTCTTTCATGGATTCAATTAATTAACAGTTTTTGTTCGTTATAAATAAATATTCCACCAAAATCCAAGAACGCCTCTTTCTCTCTCCTCTCACCCCATTTGTTTTATTCTATTTCAATATTACTAATCATTTTGGCACTTTGCACTTTTCAGTTACACACTTTCTCGCTCTCATGTAAAATCCTATCATTTCTCTGTAATTCAGTTATTGATTTCTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013668
ATGGCGCGAATGCTACTGAGCTTTCCGGCGATCGATGCCGGAGTCGGAGTGCTGTCTGACGGCTGGTGGGACGACATCAACGAATCCGTCAAATGGCAAGACGGACTATTCTTCACGCTCTGCGCTGTTTATGCCCTCGTTTCGTCCGTCGCCCTTATTCAATTGATAAGAATTGAACTAAGGGTACCTGAGTATGGATGGACTACTCAGAAGGTTTTCCACCTGATGAATTTTTTTGTGAATGGAGTGCGTGCTGTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797783.1
MARMLLSFPAIDAGVGVLSDGWWDDINESVKWQDGLFFTLCAVYALVSSVALIQLIRIELRVPEYGWTTQKVFHLMNFFVNGVRAVVFGFHKQVFFLHPKALTLVLLDLPDLLFFSTYTLLILFWAEIYHQARSLPTDKLRIFYISINGAIYLIQFCIWVYLGLDENVIVQFIGKIFIAVVSFIAALGFLIYGGRLFFMLRRFPIESKGRRKKLHEVGSVTAICFTCFLIRCLVVVLSAFYSDASLDVMYHPVLNLSYYM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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