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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000659`

染色体: Chr02 坐标: 9988220-9989482 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000659`
名称	SmilChr02G000659
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	9988220 - 9989482 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007978`
GeneID	`131007978`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007978`
原始查询	`SmilChr02G000659`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=31.3; qcov=0.988; evalue=4.16e-46; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=32.5; qcov=0.9; evalue=5.27e-52; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007978

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057790868.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790868.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790868.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790868.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790868.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:9988246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C67
`Chr2:9988281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C78,D5
`Chr2:9988429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B137
`Chr2:9988438`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C42
`Chr2:9988438`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C42
`Chr2:9988488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,B65,B89
`Chr2:9988606`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B86
`Chr2:9988606`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B86
`Chr2:9988636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B14,B20,D2,D3
`Chr2:9988662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B130,C59
`Chr2:9988662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C59
`Chr2:9988905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B35,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790868.1

420 aa

210

420

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 157-330 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790868.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	157	330	8.4e-39	133.6	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934885.1
ATGGCAGCAGCTTTCGCAGCTCTAGTTTCTCTTCAGAATAATCTACGCCTCGTCCGCACTCACCCCACCCATTCCTTTTCCTTCGAAGAAGAACAGATTGAATCTCTTTTGGAAACTGTCAGTTTCTTGATCAAATTCATGAAAAGCTACGACAATTCTCATGGGGCCACAAAAGAAGCTGCAGAAGCTCTAGAGATACGAATCGCGCGTGCAGCTCAAGCGGCTGAAGATGTGATGGAATCACATATAGTGGATCAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007978
ATGGCAGCAGCTTTCGCAGCTCTAGTTTCTCTTCAGAATAATCTACGCCTCGTCCGCACTCACCCCACCCATTCCTTTTCCTTCGAAGAAGAACAGATTGAATCTCTTTTGGAAACTGTCAGTTTCTTGATCAAATTCATGAAAAGCTACGACAATTCTCATGGGGCCACAAAAGAAGCTGCAGAAGCTCTAGAGATACGAATCGCGCGTGCAGCTCAAGCGGCTGAAGATGTGATGGAATCACATATAGTGGATCAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790868.1
MAAAFAALVSLQNNLRLVRTHPTHSFSFEEEQIESLLETVSFLIKFMKSYDNSHGATKEAAEALEIRIARAAQAAEDVMESHIVDQIRSGKTRSKTRSPRFLLDLQKVIQDMDYMRRKATNVKALSGINIEADSAAEVISSTPHMASKNSSMVGFDDVLRQLLDQLTGFPSSRRVIPIIGMGGIGKTTLATNAFQHPVIMHHFDVCLWATISQQYSVQKILTQLVSCLRKSFRKSVDESSSCETVDEMRDELYKSLFGRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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