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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000676`

染色体: Chr02 坐标: 10554034-10556727 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000676`
名称	SmilChr02G000676
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	10554034 - 10556727 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007983`
GeneID	`131007983`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007983`
原始查询	`SmilChr02G000676`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G48620` (AT5G48620) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834919] identity=27.9; qcov=0.974; evalue=1.57e-72; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=27.9; qcov=0.92; evalue=4.19e-71; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007983

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057790873.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057790873.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790873.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790873.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790873.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:10554059`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B135,B137,B8
`Chr2:10554059`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B135,B137,B8
`Chr2:10554079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C78,D5
`Chr2:10554080`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	33	B102,B107,B14,B21,B22,B23,B24,B26,B30,B40,B53,B6,B63,B91,C13,C17,C2,C23,C3,C32,C34,C36,C40,C47,C5,C68,C76,C78,C86,D1,D10,D5,D9
`Chr2:10554086`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B21
`Chr2:10554086`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B21
`Chr2:10554090`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B40,C78,D5
`Chr2:10554090`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B40,C78,D5
`Chr2:10554109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:10554153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B137,B41,B74,D8
`Chr2:10554160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,D5
`Chr2:10554186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790873.1

897 aa

448

897

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 157-329 aa PF23559 WHD_DRP 415-485 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790873.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	157	329	8.2e-38	130.4	NB-ARC domain
`XP_057790873.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	415	485	1.5e-14	54.5	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934890.1
ATGGCAGCAGCTTTCGCAGCTCTAGTTTCTCTTCAGAATAATCTACGCCTCGTCCGCACTCACCCCACCCATTCCTTTTCCTTCGAAGAAGAACAGATTGAATCTCTTTGGGAAACTGTCAGTTTCTTGATCAAATTCATGAAAAGCTACGACAATTCTCATGGGGCCACAAAAGAAGCTGCAGAAGCTCTAGAGATACGAATCGCGCGTGCAGCTCAAGCTGCTGAAGATGTGATCGAATCACATATAGTGGATCAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007983
ATGGCAGCAGCTTTCGCAGCTCTAGTTTCTCTTCAGAATAATCTACGCCTCGTCCGCACTCACCCCACCCATTCCTTTTCCTTCGAAGAAGAACAGATTGAATCTCTTTGGGAAACTGTCAGTTTCTTGATCAAATTCATGAAAAGCTACGACAATTCTCATGGGGCCACAAAAGAAGCTGCAGAAGCTCTAGAGATACGAATCGCGCGTGCAGCTCAAGCTGCTGAAGATGTGATCGAATCACATATAGTGGATCAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790873.1
MAAAFAALVSLQNNLRLVRTHPTHSFSFEEEQIESLWETVSFLIKFMKSYDNSHGATKEAAEALEIRIARAAQAAEDVIESHIVDQIRSGKTRSKTRSPRFLLDLQKVIQDMDYMRRKATNVKAQSGINEADSAAEVISSTPPMASKNSSMVGFDDVLHQLLDQLTGFPSSRRVIPIIGMGGIGKTTLATNAFQHPLTVHHFDVCLWATISQQYSVQKILIQLVSCLRKSIRKSVDESSSCETVDVIRDELYKSLFGRRY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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