当前解析结果
SmilChr02G000683| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000683 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000683 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000683 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 10780977 - 10781785 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007986 |
|---|---|
| GeneID | 131007986 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007986 |
| 原始查询 | SmilChr02G000683 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007986 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057790875.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057790875.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790875.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790875.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790875.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:10780981 |
A |
ATC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B104,C52,C6 |
Chr2:10780981 |
A |
ATC |
2bp_insertion | CDS_variant | 3 | B104,C52,C6 |
Chr2:10780989 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,B134 |
Chr2:10780996 |
CCG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B106,B111,B14,B95,C14,C40,C71,D3 |
Chr2:10781036 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 22 | A10,A11,A15,A22,B136,B23,B38,B39,B47,B53,B58,B65,B67,B70,B71,B96,C23,C39,C42,C59,C65,C84 |
Chr2:10781121 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B120,B35,C56,C65,C85 |
Chr2:10781123 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B120,C56,C65 |
Chr2:10781136 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr2:10781176 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A16,B33,B69,C56,C85 |
Chr2:10781294 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B38,C39,C65 |
Chr2:10781294 |
G |
GT |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | B38,C39,C65 |
Chr2:10781415 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B10,B18 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。