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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000697`

染色体: Chr02 坐标: 11093168-11094617 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000697`
名称	SmilChr02G000697
描述	uncharacterized SmilChr02G000697
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	11093168 - 11094617 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012963`
GeneID	`131012963`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012963`
原始查询	`SmilChr02G000697`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=high
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=64.5; qcov=0.846; evalue=3.37e-139; confidence=high
Rice	`Os06g0597250` - identity=47.4; qcov=0.505; evalue=1.86e-46; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012963

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796931.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057796931.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057796931.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796931.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796931.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:11093205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr2:11093223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C45
`Chr2:11093313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr2:11093315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C30
`Chr2:11093321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr2:11093345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B44,C11
`Chr2:11093347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C43
`Chr2:11093355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B70,C78
`Chr2:11093357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B2
`Chr2:11093359`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B42
`Chr2:11093359`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B42
`Chr2:11093361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B128,B66,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796931.1

376 aa

188

376

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 79-116 aa PF04827 Plant_tran 211-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796931.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	79	116	3e-19	69.2	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057796931.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	211	315	4.1e-56	190.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940948.1
ATGAATTATCATGATGTTGGCTCTTCTTATATATTTTCTTCTTCAAGCTCATCATCAGATGAGCTTGAAGAAATACTCAATGAATGTGATGTTGAACATCAATTGATGTGTCAACATATTTTGTCAAATAATTTCGTTGTAGCAAGCCTTATTGAAAATCAAAATGCTACAACAATCCACAGAGGCTCAGTTCCTGGTCGCAGGATGATCCATCGTGATCGAGAAGTGGCTGCCCAACGTCTGTTCAACGATTATTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012963
ATGAATTATCATGATGTTGGCTCTTCTTATATATTTTCTTCTTCAAGCTCATCATCAGATGAGCTTGAAGAAATACTCAATGAATGTGATGTTGAACATCAATTGATGTGTCAACATATTTTGTCAAATAATTTCGTTGTAGCAAGCCTTATTGAAAATCAAAATGCTACAACAATCCACAGAGGCTCAGTTCCTGGTCGCAGGATGATCCATCGTGATCGAGAAGTGGCTGCCCAACGTCTGTTCAACGATTATTTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796931.1
MNYHDVGSSYIFSSSSSSSDELEEILNECDVEHQLMCQHILSNNFVVASLIENQNATTIHRGSVPGRRMIHRDREVAAQRLFNDYFSENPTFNEGMFRRRFRMSRSLFHRIVDAVKNHNSYFQQGRDCTGRLGLSTLQKITAAFRILAYGVPADATDEYINIGESTAIKCVKKFCRAIVEIFSSQYLRSPTSSDVARLLYIGQQRGFPGIGITPPANYVIQGKEYSVGYYLADGIYPKWSTLVQTIHEPRTAKKKHFATR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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