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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000702`

染色体: Chr02 坐标: 11208006-11217996 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000702`
名称	SmilChr02G000702
描述	uncharacterized SmilChr02G000702
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	11208006 - 11217996 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011166`
GeneID	`131011166`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011166`
原始查询	`SmilChr02G000702`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837718]; symbol=AT1G11740; hit=AT1G11740; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837718]; symbol=AT1G11740; hit=AT1G11740; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G11740` (AT1G11740) ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837718] identity=46.7; qcov=1.09; evalue=2.74e-151; confidence=high
Rice	`Os02g0810100` (OJ1112_G06.34) - identity=49.2; qcov=0.662; evalue=2e-95; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF11904 (ANKRD13_C); PF12796 (Ank_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011166

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057794947.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057794947.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057794947.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794947.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794947.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:11208162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C48
`Chr2:11208192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B134,B135,B41,B61
`Chr2:11208283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:11216658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:11216666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr2:11216817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,B65,B89
`Chr2:11216862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr2:11216874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C56,C65
`Chr2:11216946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C26,C31
`Chr2:11217033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:11217035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:11217377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794947.1

476 aa

238

476

Ank_2

ANKRD13_C

PF12796 Ank_2 78-139 aa PF11904 ANKRD13_C 198-329 aa PF11904 ANKRD13_C 332-471 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794947.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	78	139	1.7e-07	32.4	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057794947.1`	Pfam	`PF11904`	ANKRD13_C	Domain	198	329	4.5e-72	244.0	ANKRD13 C-terminal
`XP_057794947.1`	Pfam	`PF11904`	ANKRD13_C	Domain	332	471	4.5e-72	244.0	ANKRD13 C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938964.1
TGGGGCAGTGTTTTGTTTTTTAGAAACCGAAAGTGGGGCACTTAATTGGCTACTATAATTATTAGATTTATCCAACATTAGATCCTTTTATTATGTGTTGTGTGGCAGTCCTGTTTTCACTGTCCTACGGTTAAAACTTAACTTGGATGCCCTTGGTTTTTTTGAGCTCATGCAAAAAGTTTAACAGTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAATTTCCTTTCTCCTATCATTTCTGTAGCAGCTATTGCACGATTGTCTGAAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011166
ATGTCCAAGTCATCAGCGAAGCCCCCGACATTCGTGACCGCCGCCGTGGTGGCAGAAGACTACGCCGACAGCCCCGTCCACTACGCGGTGGCCACAGGCGATCACGCCACCCTAACGAAGATCGTGGCCTCCCTGCCCAAACTCCACGCGGCCAACACCATCCACACCGAACCCGAATCCATCGCGGAGGAGCGCCTCGCCGATCAAATCTCCGCCGTCCTCGACCGCCGCGACAACCCCCTCAAGGAGACCCCGCTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794947.1
MSKSSAKPPTFVTAAVVAEDYADSPVHYAVATGDHATLTKIVASLPKLHAANTIHTEPESIAEERLADQISAVLDRRDNPLKETPLHVAVRLNDVKAARILAAAGAKISLHNSSGWDALQEALLRRCREIAPILVHHGHLYTQYTWRRRLPRIVGGLRRMRDFYMEISFHFESSIIPFIDRVAPSDTYRIWKRAGNLRTDATLAGFDGLNFKRRNNSYLFLNDVDRPDVPRGCLLVVKHDKKQVLVAEYDKKIGTPLSKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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