当前解析结果
SmilChr02G000706| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000706 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000706 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000706 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 11351622 - 11352593 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011188 |
|---|---|
| GeneID | 131011188 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011188 |
| 原始查询 | SmilChr02G000706 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011188 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057794968.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057794968.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057794968.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057794968.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057794968.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:11351642 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B5,C59,D7 |
Chr2:11351642 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B5,C59,D7 |
Chr2:11351646 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B129,B52,C82,D4 |
Chr2:11351651 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | C48,D6 |
Chr2:11351651 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C48,D6 |
Chr2:11351693 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr2:11351698 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C30,C48,D6 |
Chr2:11351702 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,C19,C30,C46,C53 |
Chr2:11351712 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B126,B135,B66 |
Chr2:11351719 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,B84,C72,D11 |
Chr2:11351733 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B125 |
Chr2:11351734 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 130 | A11,A14,A15,A16,A18,A19,A21,A24,A25,A4,A7,B1,B10,B103,B105,B108,B112,B113,B118,B12,B120,B122,B123,B124,B125,B128,B129,B133,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B17,B19,B20,B26,B28,B3,B32,B35,B38,B39,B41,B44,B47,B5,B50,B52,B53,B54,B57,B58,B6,B61,B63,B64,B65,B68,B69,B70,B71,B72,B79,B8,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B99,C1,C10,C13,C16,C17,C19,C20,C23,C24,C27,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C4,C40,C41,C42,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C53,C55,C56,C58,C6,C61,C62,C63,C65,C66,C67,C68,C76,C77,C78,C8,C82,C84,C86,D10,D2,D5,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。