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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000710`

染色体: Chr02 坐标: 11455871-11457025 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000710`
名称	SmilChr02G000710
描述	putative NAC domain-containing protein 94
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	11455871 - 11457025 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007991`
GeneID	`131007991`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007991`
原始查询	`SmilChr02G000710`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative NAC domain-containing protein 94
产物	putative NAC domain-containing protein 94
Arabidopsis	`AT5G39820` (NAC094) NAC domain containing protein 94 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833978] identity=36.6; qcov=0.676; evalue=3.9e-17; confidence=low
Rice	`Os06g0344900` (OMTN5) - identity=30.3; qcov=0.738; evalue=4.45e-17; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007991

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790881.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790881.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790881.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790881.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790881.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:11455887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B12,B68,C51
`Chr2:11456045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C56,C65
`Chr2:11456076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr2:11456119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C41,D8
`Chr2:11456119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,D8
`Chr2:11456137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,C73,D3
`Chr2:11456141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr2:11456194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B94,C6
`Chr2:11456741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C17
`Chr2:11456790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:11456834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:11456882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790881.1

210 aa

105

210

NAM

PF02365 NAM 56-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790881.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	56	180	1.1e-28	100.8	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934898.1
ATGGCTTCCCAGGTGCCCTCGTATTATCCATTCAACGAATTTGCGCCGCTGCCGCCATTGGACGCCGCCTCTCTCTCGATCGAAGACTATCCCCCTTATGATCAACCGTTCGAATTAGATTGCGGCGGAGGTGGCGGCAGCGGCGGCGGCAACTCTGTTTATGCTCCCGGGTTTAAGTTCCGGCCAACCGACGAGGAACTGATCGTGCACTACCTACAGCCGGAGTTTATTAAAGCCTCTCTTCCGCAGACAAGGATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007991
ATGGCTTCCCAGGTGCCCTCGTATTATCCATTCAACGAATTTGCGCCGCTGCCGCCATTGGACGCCGCCTCTCTCTCGATCGAAGACTATCCCCCTTATGATCAACCGTTCGAATTAGATTGCGGCGGAGGTGGCGGCAGCGGCGGCGGCAACTCTGTTTATGCTCCCGGGTTTAAGTTCCGGCCAACCGACGAGGAACTGATCGTGCACTACCTACAGCCGGAGTTTATTAAAGCCTCTCTTCCGCAGACAAGGATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790881.1
MASQVPSYYPFNEFAPLPPLDAASLSIEDYPPYDQPFELDCGGGGGSGGGNSVYAPGFKFRPTDEELIVHYLQPEFIKASLPQTRIIKHADIYDYEPHQLSGLVEEDHGDGKMYFYTMIKKIGKSKTDRSIKSKKGNWKPTQAPKEIKGSISGTIIGYRTSLKYYEDKKKTQWLMQEYKLNTSHHSSRQLVLAVVYFHPQKKADDSDDDC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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