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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000712`

染色体: Chr02 坐标: 11478624-11480061 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000712`
名称	SmilChr02G000712
描述	putative NAC domain-containing protein 94
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	11478624 - 11480061 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011200`
GeneID	`131011200`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011200`
原始查询	`SmilChr02G000712`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative NAC domain-containing protein 94
产物	putative NAC domain-containing protein 94
Arabidopsis	`AT5G39820` (NAC094) NAC domain containing protein 94 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833978] identity=36.6; qcov=0.676; evalue=4.71e-17; confidence=low
Rice	`Os11g0126900` (NAC122) - identity=31.1; qcov=0.795; evalue=5.57e-17; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011200

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794977.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794977.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794977.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794977.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794977.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:11478783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B52,B92
`Chr2:11478799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B54,B67,C39,C65
`Chr2:11478807`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B131,B29,B66,C26
`Chr2:11478807`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B131,B29,B66,C26
`Chr2:11478809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	B131,B133,B18,B28,B29,B34,B45,B60,B66,B69,B72,B75,B78,B81,C26,C41,C46,D8
`Chr2:11478888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A2,A25,A6,B101,B102,B113,B122,B13,B132,B134,B135,B138,B16,B22,B3,B32,B46,B52,B74,B79,B92,C22,C24,C28,C38,C50,C60,C61,C63,C73,C85,C87,D3
`Chr2:11478893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A25,B102,B125,B134,B3,B50,C38,C63
`Chr2:11478958`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A13,B117,B21,B58,B66,B84,B93,B94,C43,C55,C79,C8
`Chr2:11478971`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B53,B9,C73,D5
`Chr2:11478971`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B53,B9,C73,D5
`Chr2:11478985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,D5
`Chr2:11478998`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A21,A25,B118,B123,B126,B18,B2,B23,B4,B40,B44,B5,B53,B62,B71,B9,C16,C18,C44,C53,C67,C69,C70,C73,C78,C80,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794977.1

210 aa

105

210

NAM

PF02365 NAM 56-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794977.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	56	180	2.7e-28	99.6	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938994.1
TCCCCGATCATGAGTCGGACTCGATACTAATCCTAATATATAAAGAGTAGTACCTAATTTGCATCACAATCAAATTGATTCTCAAGAATTATAATTAATGGCTTCTCAGGTGCCCTCATATTATCCATTCAACGAATTTGCGCCGCTGCCGCCATTGGACGCCGCCTCTCTCACGATCGAAGACTATCCCCCTTATGATCAACCGTTCGAATTAGATTGCGGCGGAGGTGGCGGCAGCGGCGGCGGCAACTCTGTTTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011200
ATGGCTTCTCAGGTGCCCTCATATTATCCATTCAACGAATTTGCGCCGCTGCCGCCATTGGACGCCGCCTCTCTCACGATCGAAGACTATCCCCCTTATGATCAACCGTTCGAATTAGATTGCGGCGGAGGTGGCGGCAGCGGCGGCGGCAACTCTGTTTATGCTCCCGGGTTTAAGTTCCGGCCGACCGACGAGGAGCTGATCGTGCACTACCTACAGCTGGAGTTTATTAAAGCCTCTCTTCCGCAGACAAGGATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794977.1
MASQVPSYYPFNEFAPLPPLDAASLTIEDYPPYDQPFELDCGGGGGSGGGNSVYAPGFKFRPTDEELIVHYLQLEFIKASLPQTRIIKHADIYDYEPHQLSGLVEEDHGDGKMYFYTMIKKIGKSKTDRSIKSKKGNWKPTQAPKEIKGSISGTIIGYKTSFKYYEDKKKTQWLMQEYKLNTSHHSSRQLVLAVVYFHPQKKADDSDDDC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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