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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000722`

染色体: Chr02 坐标: 11615294-11617381 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000722`
名称	SmilChr02G000722
描述	NAC domain-containing protein 19-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	11615294 - 11617381 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011209`
GeneID	`131011209`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011209`
原始查询	`SmilChr02G000722`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAC domain-containing protein 19-like
产物	NAC domain-containing protein 19-like
Arabidopsis	`AT1G61110` (NAC025) NAC domain containing protein 25 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842404] identity=53; qcov=0.393; evalue=5.54e-54; confidence=low
Rice	`Os07g0566500` (NAC010) - identity=50.3; qcov=0.439; evalue=3.13e-55; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011209

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794982.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794982.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794982.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794982.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794982.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:11615363`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B10,B135
`Chr2:11615363`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B10,B135
`Chr2:11615368`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	71	A1,A14,A18,A19,A2,A24,A25,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B104,B106,B108,B110,B119,B12,B122,B124,B127,B132,B19,B2,B20,B25,B29,B3,B31,B34,B35,B42,B43,B48,B5,B56,B72,B74,B77,B86,B9,B93,B95,B96,C10,C12,C2,C22,C24,C28,C29,C32,C35,C38,C4,C43,C48,C6,C61,C63,C68,C71,C75,C76,C79,C81,C82,C85,C9,D11
`Chr2:11615393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:11615423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C87
`Chr2:11615467`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B114,B8,C17,C21,C4,C46,C47,D1
`Chr2:11615575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B14,C76,D3
`Chr2:11615716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B14,C76,D3
`Chr2:11615803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:11615841`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A11,A15,B119,B136,B47,B56,B96,C23,C39,C65,C84
`Chr2:11616095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:11617253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794982.1

417 aa

208

417

NAM

PF02365 NAM 33-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794982.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	33	158	2.3e-41	141.8	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938999.1
AGTGTATCTTGGTTTGAAGCTTGTATTTCACGCTTCACATTCTCTCGATCAGCTCCCACTACTTCCCAGCATGGATCATCAAGAAACAGAGCAGCGGCACTCGGAAGATGAACAAATTCGGGCACCGGCAGCTCCAATGGCCGTGCCGGCGTGGAAGAGTTATGCGCCGGGGTTTCGTTTCAGGCCCACTGACGGCGAGCTCATTGTGGAATACTTGCAGAAGAAAATCGACAACCAGCCTATCCCCGTTGATGGAATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011209
ATGGATCATCAAGAAACAGAGCAGCGGCACTCGGAAGATGAACAAATTCGGGCACCGGCAGCTCCAATGGCCGTGCCGGCGTGGAAGAGTTATGCGCCGGGGTTTCGTTTCAGGCCCACTGACGGCGAGCTCATTGTGGAATACTTGCAGAAGAAAATCGACAACCAGCCTATCCCCGTTGATGGAATGAATGAGACTAATCTCAAAGAAGTCAACCCCTGGGACATACAAGCGAACTTTCCGAAACTGGGATATGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794982.1
MDHQETEQRHSEDEQIRAPAAPMAVPAWKSYAPGFRFRPTDGELIVEYLQKKIDNQPIPVDGMNETNLKEVNPWDIQANFPKLGYEEEWYFFTPRDRKYPNGERPDRGSESGYWKATGADKPVMVGDATIGFRKALVFYQGKPQKGVKTKWIMHEYRVNAPARKKRSKDDMRLDDWVLCHMYEKATRLPNNKRKNPNAKEAKEQSDDDSDSEFAVVGNDDDDDNEVAAAIENLPGILPENPYPFNYYYPEQNPAYLEDIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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