当前解析结果
SmilChr02G000724| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000724 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000724 |
| 描述 | peroxisomal membrane protein PMP22-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 11701744 - 11705225 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011211 |
|---|---|
| GeneID | 131011211 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011211 |
| 原始查询 | SmilChr02G000724 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | peroxisomal membrane protein PMP22-like |
| 产物 | peroxisomal membrane protein PMP22-like |
| Arabidopsis | AT4G04470 (PMP22)Peroxisomal membrane 22 kDa (Mpv17/PMP22) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825777] identity=61.4; qcov=0.995; evalue=2.09e-84; confidence=high |
| Rice | Os02g0226000- identity=59; qcov=0.989; evalue=6.8e-82; confidence=high |
| GO | GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF04117 (Mpv17_PMP22) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011211 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.80000 | XP_057794984.1 |
| 2 | Peroxisome membrane | 过氧化物酶体膜 | 0.60000 | XP_057794984.1 |
| 3 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.40000 | XP_057794984.1 |
| 4 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.40000 | XP_057794984.1 |
| 5 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.20000 | XP_057794984.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:11701922 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057794984.1PF04117
Mpv17_PMP22 114-174 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057794984.1 |
Pfam | PF04117 |
Mpv17_PMP22 | Family | 114 | 174 | 2.7e-17 | 63.2 | Mpv17 / PMP22 family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。