当前解析结果
SmilChr02G000725| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000725 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000725 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000725 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 11784668 - 11785267 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007995 |
|---|---|
| GeneID | 131007995 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007995 |
| 原始查询 | SmilChr02G000725 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007995 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790885.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057790885.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790885.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790885.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790885.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:11784700 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,C25 |
Chr2:11784736 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B136,B68,C19 |
Chr2:11784813 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B98 |
Chr2:11784824 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,B100 |
Chr2:11784835 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C23 |
Chr2:11784850 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B115 |
Chr2:11784864 |
TTA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 24 | B103,B106,B107,B125,B129,B16,B28,B33,B40,B41,B44,B65,B98,C1,C20,C21,C23,C30,C44,C46,C49,C58,C75,C87 |
Chr2:11784867 |
C |
CCT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B28 |
Chr2:11784867 |
C |
CCT |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr2:11784868 |
C |
CCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 23 | B103,B106,B107,B125,B129,B16,B33,B40,B41,B44,B65,B98,C1,C20,C21,C23,C30,C44,C46,C49,C58,C75,C87 |
Chr2:11784880 |
CCT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 5 | A25,B10,B106,B44,B78 |
Chr2:11784880 |
CCT |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | A25,B10,B106,B44,B78 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。