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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000729`

染色体: Chr02 坐标: 11835444-11836937 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000729`
名称	SmilChr02G000729
描述	uncharacterized SmilChr02G000729
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	11835444 - 11836937 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007996`
GeneID	`131007996`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007996`
原始查询	`SmilChr02G000729`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G15685` (AT5G15685) mutator transposase MUDRA protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721163] identity=37.3; qcov=0.487; evalue=3.18e-22; confidence=medium
Rice	`Os06g0704400` - identity=32.1; qcov=0.596; evalue=2.59e-25; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007996

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790886.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790886.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790886.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790886.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790886.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:11835539`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	84	A1,A11,A14,A15,A2,A22,A23,A7,A8,A9,B1,B10,B105,B11,B117,B119,B122,B128,B131,B136,B137,B140,B16,B2,B20,B22,B25,B26,B27,B32,B33,B37,B39,B42,B56,B57,B6,B60,B68,B73,B79,B82,B85,B94,B95,B96,C13,C18,C23,C25,C28,C34,C35,C39,C43,C48,C49,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C60,C61,C67,C68,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C80,C84,C85,C87,D10,D2,D6,D7,D8,D9
`Chr2:11835548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B112,B67,C12,C41
`Chr2:11835561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B112,B67,C12,C41
`Chr2:11835563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B112,B67,C12,C41
`Chr2:11835568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B112,B67,C12,C41
`Chr2:11835570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B120
`Chr2:11835612`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A11,A15,B128,B136,B47,B53,B56,B60,B95,B96,C23,C39,C51,C52,C54,C57,C84,D10,D9
`Chr2:11835619`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C87,D10
`Chr2:11835619`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C87,D10
`Chr2:11835650`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A14,A18,A19,A2,A24,A7,A9,B101,B103,B106,B108,B11,B120,B122,B136,B18,B23,B28,B3,B37,B40,B42,B43,B48,B55,B59,B6,B62,B71,B77,C15,C16,C34,C38,C47,C49,C53,C56,C61,C63,C66,C7,C78,C85
`Chr2:11835656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B120
`Chr2:11835719`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790886.1

314 aa

157

314

MULE

PF10551 MULE 78-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790886.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	78	162	4.3e-13	50.2	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934903.1
ATGGGTCAGATTGTGACTGATCGCAATAGAAAAGCTAGTATTTTTAGGAGGGATATGATGGTTGACCTGGGCTGTGAGATAAATGTTAATCAAGCCCATAGAGCTAAGAAAGTCGCTCTGCAAAATCTTGAAGGAAATAGTGATATGCAATATGCTAAGTTGTGGGAGTACTCTAAAGAGATAAGGAGGACAAATCCTGGGTCCACAGCCTTCAAGTTTTGCAGGCCTATTATTGGAATTGATGGGTGCCATCTAAAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007996
ATGGGTCAGATTGTGACTGATCGCAATAGAAAAGCTAGTATTTTTAGGAGGGATATGATGGTTGACCTGGGCTGTGAGATAAATGTTAATCAAGCCCATAGAGCTAAGAAAGTCGCTCTGCAAAATCTTGAAGGAAATAGTGATATGCAATATGCTAAGTTGTGGGAGTACTCTAAAGAGATAAGGAGGACAAATCCTGGGTCCACAGCCTTCAAGTTTTGCAGGCCTATTATTGGAATTGATGGGTGCCATCTAAAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790886.1
MGQIVTDRNRKASIFRRDMMVDLGCEINVNQAHRAKKVALQNLEGNSDMQYAKLWEYSKEIRRTNPGSTAFKFCRPIIGIDGCHLKGPYHGIMLTAVGMDANNGIYPIAKGVVSNECKDTWGWFLVVLKQDLGIEDDSEYTFMSDKQKCLIQAMSFVFPNARNVNIDYARMDRKHGIMVRFQTSREISTTKWRWRICPRIKQLLENNVGKRQKRDDFVHECYSVETFKKIYAASIIGVSGPQLWNDSMYIPPLPPRMEKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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