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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000737`

染色体: Chr02 坐标: 11948946-11949389 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000737`
名称	SmilChr02G000737
描述	probable calcium-binding protein CML15
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	11948946 - 11949389 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008000`
GeneID	`131008000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008000`
原始查询	`SmilChr02G000737`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable calcium-binding protein CML15
产物	probable calcium-binding protein CML15
Arabidopsis	`AT1G18530` (AT1G18530) EF hand calcium-binding protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838434] identity=59.7; qcov=0.524; evalue=6.41e-25; confidence=medium
Rice	`Os05g0577500` (OsCML14) - identity=48.1; qcov=0.551; evalue=5.91e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790889.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790889.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790889.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790889.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790889.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:11948951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr2:11948974`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A15,B128,B56,B60,B96,C52,C54,C57,C84,D9
`Chr2:11948986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr2:11949002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	49	A16,A19,A21,A22,A23,A25,A5,B10,B103,B114,B122,B127,B135,B18,B3,B47,B51,B59,B63,B64,B65,B74,B76,B8,B81,B83,B89,B95,C14,C17,C21,C27,C29,C30,C33,C4,C45,C46,C5,C50,C53,C63,C64,C66,C80,C83,D1,D11,D3
`Chr2:11949008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,D3
`Chr2:11949009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:11949047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A16,A25,B131,C27,C29,C30,C45,C63
`Chr2:11949070`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B134,B41,B61
`Chr2:11949070`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B134,B41,B61
`Chr2:11949083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:11949089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:11949113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B115,B136,B55

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934906.1
ATGGGTGCGAGCTTTGACGAGTTGGACAGCAGCGACGAGGCTTCGAGCCCTCGTTCGTGCGGCGAACAGAGGCGACTCGCGGCCCTGGCTCCCCTCCGCTCCCTCGGCCTCAAGCCAACTGGCAACCAAATCCACACTATCTCCACCTCCATCAACGCCAACGGCAATGGAGCCATAGAGTTTCATGAATTGGTGGAGCTTATGTTGTCCGACATTAGCATAGAAGTCATCCCCAACCACGAACACCTAATGAAGGTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008000
ATGGGTGCGAGCTTTGACGAGTTGGACAGCAGCGACGAGGCTTCGAGCCCTCGTTCGTGCGGCGAACAGAGGCGACTCGCGGCCCTGGCTCCCCTCCGCTCCCTCGGCCTCAAGCCAACTGGCAACCAAATCCACACTATCTCCACCTCCATCAACGCCAACGGCAATGGAGCCATAGAGTTTCATGAATTGGTGGAGCTTATGTTGTCCGACATTAGCATAGAAGTCATCCCCAACCACGAACACCTAATGAAGGTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790889.1
MGASFDELDSSDEASSPRSCGEQRRLAALAPLRSLGLKPTGNQIHTISTSINANGNGAIEFHELVELMLSDISIEVIPNHEHLMKVFKAFDRDGNRFISAVEPETASFEDDNIERASTTAKASTASGVGRGFNDGSGLDVEQRGRGL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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