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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000740`

染色体: Chr02 坐标: 11991948-11992729 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000740`
名称	SmilChr02G000740
描述	uncharacterized SmilChr02G000740
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	11991948 - 11992729 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008001`
GeneID	`131008001`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008001`
原始查询	`SmilChr02G000740`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	KMK0024M20.35; symbol=KMK0024M20.35; hit=Os06g0158600; species=rice; confidence=high
产物	KMK0024M20.35; symbol=KMK0024M20.35; hit=Os06g0158600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G46230` (AT2G46230) PIN domain-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819231] identity=77.5; qcov=1; evalue=1.08e-64; confidence=high
Rice	`Os06g0158600` (KMK0024M20.35) - identity=82.6; qcov=1.01; evalue=3.18e-69; confidence=high
GO	GO:0005730 (nucleolus); GO:0032040 (small-subunit processome)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04900 (Fcf1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008001

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790890.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057790890.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057790890.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057790890.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790890.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:11991960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B61
`Chr2:11991965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B37
`Chr2:11992016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C17,C56,C65,C76
`Chr2:11992024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A24,A4,A5,A9,B104,B117,B15,B19,B36,B79,B85,B94,B99,C11,C30,C39,C42,C58,C69,C87
`Chr2:11992153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:11992156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:11992170`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A6,A8,B105,B109,B25,B40,B68,B8,B82,B97,C40,C72
`Chr2:11992177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,D11
`Chr2:11992313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B129,B84,B91
`Chr2:11992313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B84,B91
`Chr2:11992327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:11992349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790890.1

120 aa

120

Fcf1

PF04900 Fcf1 90-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790890.1`	Pfam	`PF04900`	Fcf1	Domain	90	119	3e-07	31.4	Fcf1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934907.1
ACTGAAGATGGGGAAAGCGAAGAAAACTCCTAAATTTGCTGTTATGAAGAAAATCGTCACCCATAAAGCAATTAAACAGTACAAGGAGGATGTCTTGAACCCTAATAGGAAAGACTTGACCAAGGAGAAACTCCCCCGCAATGTGCCGCAAGTTTCATCAGCGCTTTACTTCAAGCACAATACTGCTTTAGGGCCGCCATACCGAGTATTGGTGGATACTAATTTCATTAATTTCTCCATCCAAAATAAATTAGATTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008001
ATGGGGAAAGCGAAGAAAACTCCTAAATTTGCTGTTATGAAGAAAATCGTCACCCATAAAGCAATTAAACAGTACAAGGAGGATGTCTTGAACCCTAATAGGAAAGACTTGACCAAGGAGAAACTCCCCCGCAATGTGCCGCAAGTTTCATCAGCGCTTTACTTCAAGCACAATACTGCTTTAGGGCCGCCATACCGAGTATTGGTGGATACTAATTTCATTAATTTCTCCATCCAAAATAAATTAGATTTGGAGAAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790890.1
MGKAKKTPKFAVMKKIVTHKAIKQYKEDVLNPNRKDLTKEKLPRNVPQVSSALYFKHNTALGPPYRVLVDTNFINFSIQNKLDLEKAMVDCLYAKCTPCITDCVMAELEKLGQKYRVALR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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