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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000743`

染色体: Chr02 坐标: 12015330-12018519 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000743`
名称	SmilChr02G000743
描述	uncharacterized SmilChr02G000743
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	12015330 - 12018519 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011223`
GeneID	`131011223`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011223`
原始查询	`SmilChr02G000743`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucose-induced degradation-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818345]; symbol=AT2G37680; hit=AT2G37680; species=arabidopsis; confidence=high
产物	glucose-induced degradation-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818345]; symbol=AT2G37680; hit=AT2G37680; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G37680` (AT2G37680) glucose-induced degradation-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818345] identity=78.6; qcov=1; evalue=2.05e-129; confidence=high
Rice	`Os03g0679000` - identity=73.4; qcov=1.01; evalue=1.1e-120; confidence=high
GO	GO:0006623 (protein targeting to vacuole); GO:0007039 (protein catabolic process in the vacuole); GO:0019898 (extrinsic component of membrane); GO:0034657 (GID complex); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0045721 (negative regulation of gluconeogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF09783 (Vac_ImportDeg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011223

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057794993.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057794993.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794993.1`
4	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057794993.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057794993.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:12016067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B115,B136,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794993.1

215 aa

108

215

Vac_ImportDeg

PF09783 Vac_ImportDeg 31-199 aa

XP_057794994.1

215 aa

108

215

Vac_ImportDeg

PF09783 Vac_ImportDeg 31-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794993.1`	Pfam	`PF09783`	Vac_ImportDeg	Family	31	199	7.8e-49	166.3	Vacuolar import and degradation protein
`XP_057794994.1`	Pfam	`PF09783`	Vac_ImportDeg	Family	31	199	7.8e-49	166.3	Vacuolar import and degradation protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939010.1
CACTGTTCTTTTCTTATAAAGACCATGTCTCAAATTAAAAAAATGGCCCAACTTTGATAAGTAAAATCAAGCCCAAACTAACAAATCTCTCTCTTTCTCTCTCATATACAATCGGTCTCCTCTCTCTCCTCGTATCTCTCATTCTCTCTCAATCTCACAGTCACAGATACGCACACACATCCCCCCACCGCTTCCTCCTCCGGCGAAGGGCGCCGCCCTCGACCACCGCCGCCAAAGGCATCTCCTCCGTCTCGCCTCTC...

XM_057939011.1
CAACTTTGATAAGTAAAATCAAGCCCAAACTAACAAATCTCTCTCTTTCTCTCTCATATACAATCGGTCTCCTCTCTCTCCTCGTATCTCTCATTCTCTCTCAATCTCACAGTCACAGATACGCACACACATCCCCCCACCGCTTCCTCCTCCGGCGAAGGGCGCCGCCCTCGACCACCGCCGCCAAAGGCATCTCCTCCGTCTCGCCTCTCGCTCCCTGTCTACCCCCTTCTAGCAGTCAGCGCGCACGGCAAGGCTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011223
ATGCCGGTGAGAATGGTGGAGACTTCTTCTCCATCTGAAGTTCCAGGTGCAACTACTGGAAATACTATGATGCCCCAGCCCTGTACACTTTTAAGTGTTGGACAGGCTTTCTCGGGGACTCAGAATGTTTCGAGTCTACAGAAAGATGAAGCTTGGAGAGTGAATGTACGAATCCAGGGTTATGACCATGATCATGGATATCTATGTGGCACAATGGAAGCTCTGAATGTTCCCATGGCAGACACTCCAGTTGTTACGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057794993.1
MPVRMVETSSPSEVPGATTGNTMMPQPCTLLSVGQAFSGTQNVSSLQKDEAWRVNVRIQGYDHDHGYLCGTMEALNVPMADTPVVTFWEGEIVDTKNYTFYTGKWGATREDDIKHWTKFPSFPPLLPKVEADGGKSLDLSNYPYIFMRWKEQHFVNVGTDCGLTIAGFYYVCFSCSDGSINGFYYDPNSSPFQKLELKSTNVGRSGFSFSTYELQ

XP_057794994.1
MPVRMVETSSPSEVPGATTGNTMMPQPCTLLSVGQAFSGTQNVSSLQKDEAWRVNVRIQGYDHDHGYLCGTMEALNVPMADTPVVTFWEGEIVDTKNYTFYTGKWGATREDDIKHWTKFPSFPPLLPKVEADGGKSLDLSNYPYIFMRWKEQHFVNVGTDCGLTIAGFYYVCFSCSDGSINGFYYDPNSSPFQKLELKSTNVGRSGFSFSTYELQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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