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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000751`

染色体: Chr02 坐标: 12261593-12263105 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000751`
名称	SmilChr02G000751
描述	senescence-specific cysteine protease SAG39-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	12261593 - 12263105 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011230`
GeneID	`131011230`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011230`
原始查询	`SmilChr02G000751`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	senescence-specific cysteine protease SAG39-like
产物	senescence-specific cysteine protease SAG39-like
Arabidopsis	`AT3G49340` (AT3G49340) Cysteine proteinases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824096] identity=49.4; qcov=1.01; evalue=7.26e-111; confidence=high
Rice	`Os12g0273800` - identity=50.8; qcov=1.02; evalue=1.44e-116; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0005615 (GO:0005615); GO:0005764 (lysosome); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	-
Pfam	PF00112 (Peptidase_C1); PF08246 (Inhibitor_I29)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011230

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057794997.1`
2	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057794997.1`
3	Phagosome	Phagosome	0.20000	`XP_057794997.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057794997.1`
5	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057794997.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:12261857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:12261887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C30
`Chr2:12262853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B53,B71
`Chr2:12262878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B115,B136,B55
`Chr2:12262915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:12262917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:12262977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:12263068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794997.1

306 aa

153

306

Inhibitor_I29

Peptidase_C1

PF08246 Inhibitor_I29 5-62 aa PF00112 Peptidase_C1 92-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794997.1`	Pfam	`PF08246`	Inhibitor_I29	Domain	5	62	9.5e-21	74.6	Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)
`XP_057794997.1`	Pfam	`PF00112`	Peptidase_C1	Domain	92	305	2.7e-73	247.4	Papain family cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939014.1
ATGTTTGTTAAACACAAGCAATGGATGGCTCAACATGGACGCTACTACAAGAATGAGGAAGAGAAGGTGAAACGGTTTAAGATATTTAAAGAGAATGTGCAACACATAGAAAGCTTCAACAGAGAAGGGAGCCACACATACAAGCTTAGGATCAACAAATTTGCAGATCTAACTAATGAAGAGTTCTTGGCTAAGTATGGAGGAAATTTGAAGCCATCTTTCTCGATGATTCCATCAAATCAATCATCTTTTGAATATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011230
ATGTTTGTTAAACACAAGCAATGGATGGCTCAACATGGACGCTACTACAAGAATGAGGAAGAGAAGGTGAAACGGTTTAAGATATTTAAAGAGAATGTGCAACACATAGAAAGCTTCAACAGAGAAGGGAGCCACACATACAAGCTTAGGATCAACAAATTTGCAGATCTAACTAATGAAGAGTTCTTGGCTAAGTATGGAGGAAATTTGAAGCCATCTTTCTCGATGATTCCATCAAATCAATCATCTTTTGAATATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794997.1
MFVKHKQWMAQHGRYYKNEEEKVKRFKIFKENVQHIESFNREGSHTYKLRINKFADLTNEEFLAKYGGNLKPSFSMIPSNQSSFEYGNVKDVPPSLDWRDHNAVTPVQNQGQCGCCWAFTAVAAIEGIEAIRSGELTPLSEQHILDCNYGHEGCQGGRMDHAFDFVAKNGGLASDTDYPYTGTQGACAINKPSSLSSRITGFVFVPNNDEAALLAAVANQPVSVAIDPKLFQFYHSGVLTGECGTNLTHAVTVVGYGESE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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