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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000763`

染色体: Chr02 坐标: 12431552-12433724 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000763`
名称	SmilChr02G000763
描述	light-induced protein, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	12431552 - 12433724 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011242`
GeneID	`131011242`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011242`
原始查询	`SmilChr02G000763`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	light-induced protein, chloroplastic-like
产物	light-induced protein%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G04020` (FIB) fibrillin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825714] identity=63.6; qcov=1.01; evalue=8.19e-131; confidence=high
Rice	`Os09g0133600` (PAP2) - identity=59.8; qcov=0.94; evalue=4.47e-115; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04755 (PAP_fibrillin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011242

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795013.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057795013.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057795013.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795013.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795013.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:12431730`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A10,A13,B102,B110,B118,B130,B139,B20,B29,B31,B72,B77,B84,C12,C18,C27,C29,C46,C6,C72,C79,C81,D10
`Chr2:12431852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr2:12431947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr2:12432000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B135
`Chr2:12433094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B37,B54
`Chr2:12433219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D4
`Chr2:12433244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr2:12433481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B76,B98,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795013.1

315 aa

158

315

PAP_fibrillin

PF04755 PAP_fibrillin 89-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795013.1`	Pfam	`PF04755`	PAP_fibrillin	Family	89	305	2e-76	257.1	PAP_fibrillin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939030.1
CTTCACCTCACAAATGCATTACATGATATACTATAAACTAATTAGCAGATGTCTAAAAGACTAAAATAACCCATCAATACAGACAAACCCATCAAACACAGCAAGGGCATTCTCGTCAAAATTTGCCGTATAAATTTCGTCTTAGAAAAACTGATCATCACTCTGTTTTCCTCTGTTTAAGCTCACGTTTCTCCAATCAAAAAGAAAAACACCATAAGTCATGATATCTTCTGTCGCTTCAGCCTCCGCAAAAATGGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011242
ATGATATCTTCTGTCGCTTCAGCCTCCGCAAAAATGGCGTCAACCGCTTCTGTCAATCAGTTCCCCTGTAAGTTCCCGCAGAGCTCGAAATTGATCTCCAACAACGCGTGTTCTCCGGTCAATCGGATCAATTTCCCCGCCCTGTCGACGAAGCCGAAGGTGAATTTTGGCGTGAGGGCGGCGGTGAGCGACGACGAGTGGGGCGCCGATCCAGAATCACCGGCGGTGGCGGTTATGGAGGAGAAGGCGCCGGAAGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795013.1
MISSVASASAKMASTASVNQFPCKFPQSSKLISNNACSPVNRINFPALSTKPKVNFGVRAAVSDDEWGADPESPAVAVMEEKAPEEIDSLKKQLVDSFYGTKRGLSASAETRGEIVELISQLEAKNPTPAPTEALTLLNGKWILVYTTFSGLFPLLSRGAALSPVKVEEISQTIDSVSFTVQNSVLFAGPLATTSITTNAKFEVRSPKRVQIKFEGGVIGTPQLTDSIELPENVELLGQKIDLSPFKGLLTSVQDTASSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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