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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000768`

染色体: Chr02 坐标: 12668537-12669236 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000768`
名称	SmilChr02G000768
描述	pre-mRNA polyadenylation factor FIP1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	12668537 - 12669236 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008006`
GeneID	`131008006`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008006`
原始查询	`SmilChr02G000768`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA polyadenylation factor FIP1-like
产物	pre-mRNA polyadenylation factor FIP1-like
Arabidopsis	`AT5G58040` (FIP1[V]) FIP1[V]-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835916] identity=47; qcov=0.4; evalue=8.78e-12; confidence=low
Rice	`Os03g0308900` - identity=39.1; qcov=0.388; evalue=7.35e-10; confidence=low
GO	GO:0006397 (mRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF05182 (Fip1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008006

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790894.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057790894.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790894.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790894.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790894.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:12668540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:12668653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:12668792`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B40,C86
`Chr2:12668792`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B40,C86
`Chr2:12668801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,B98,C13,C62
`Chr2:12668999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr2:12669166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr2:12669178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B109,B26,B82,D2
`Chr2:12669185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,B98,C13,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790894.1

165 aa

165

Fip1

PF05182 Fip1 104-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790894.1`	Pfam	`PF05182`	Fip1	Motif	104	142	1.8e-19	69.7	Fip1 motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934911.1
ATGGAAGCAGATGAAGAAGAAGGGGAGTTGTGTGCAGAGAAGTGGAAAACTCCCACTCCCATTTATTCAAACCAAAATCCCAAAATCTGGACATCCAAACAAAGAGACATAATTCCGGTGCTGGTTGCAGATACATTCTATGATAAAGTGCTGAGACATGCCACAGATGGCATTGATATACCAGCTTTGCTCAATATCCCTCCTAAACCTACAGCTGCCCAATCTAAACGCTTATGTGCTACAAAAACTGAGTTTAGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008006
ATGGAAGCAGATGAAGAAGAAGGGGAGTTGTGTGCAGAGAAGTGGAAAACTCCCACTCCCATTTATTCAAACCAAAATCCCAAAATCTGGACATCCAAACAAAGAGACATAATTCCGGTGCTGGTTGCAGATACATTCTATGATAAAGTGCTGAGACATGCCACAGATGGCATTGATATACCAGCTTTGCTCAATATCCCTCCTAAACCTACAGCTGCCCAATCTAAACGCTTATGTGCTACAAAAACTGAGTTTAGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790894.1
MEADEEEGELCAEKWKTPTPIYSNQNPKIWTSKQRDIIPVLVADTFYDKVLRHATDGIDIPALLNIPPKPTAAQSKRLCATKTEFSQRDFVRKLGVMLYSNKAINFDDFEEKMWRNPGADATDFFNYGLDEKQWKDYCKEMHALIHGRVQDQLQQIEVSTLLLLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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