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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000770`

染色体: Chr02 坐标: 12674100-12676684 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000770`
名称	SmilChr02G000770
描述	uncharacterized SmilChr02G000770
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	12674100 - 12676684 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008007`
GeneID	`131008007`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008007`
原始查询	`SmilChr02G000770`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008007

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790895.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790895.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790895.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790895.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790895.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:12674232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr2:12675269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D7
`Chr2:12675288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr2:12675290`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C28
`Chr2:12675290`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C28
`Chr2:12675315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C17,C2,C68
`Chr2:12675326`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A25
`Chr2:12675326`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A25
`Chr2:12675329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D2
`Chr2:12675333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C14
`Chr2:12675344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,C62
`Chr2:12675347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790895.1

453 aa

226

453

DUF8566

DUF1985

PF29561 DUF8566 60-236 aa PF09331 DUF1985 81-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790895.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	60	236	1.2e-08	35.7	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057790895.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	81	215	1e-10	42.4	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934912.1
TTTTACTTCACCACACACCTCTATCGGCTTCTTCACTTTTACCCACCGAGAGCTTCTTCACTTTTACCCACCGAGAGAGAGAGTTCAAAAGATTGAAGCACCCTCGGACTCATCCATGGCATCTTCTTCACAGGCGAATGTCCCATATCTTCGTCGCGACACTATAAACCAGACGGAGGTTGCTATCAGCACCTACTATAGGGATTCACATTTTCCGGAGCTGGTTGAAACTTTAAATGTGGTCGGCGAACAGTGCAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008007
ATGGCATCTTCTTCACAGGCGAATGTCCCATATCTTCGTCGCGACACTATAAACCAGACGGAGGTTGCTATCAGCACCTACTATAGGGATTCACATTTTCCGGAGCTGGTTGAAACTTTAAATGTGGTCGGCGAACAGTGCAATTCAGATTTATTGGGAAGATTTAGAGCATCATGTTTTGGGCATTTCACTGATTGGAGGCCCGGCCCGAAGAGCAATAAAGCATTACACCAGATTGTATCGAGGCAGATTGTGTCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790895.1
MASSSQANVPYLRRDTINQTEVAISTYYRDSHFPELVETLNVVGEQCNSDLLGRFRASCFGHFTDWRPGPKSNKALHQIVSRQIVSEDDEMCFFLCGARVRFSPADNALVTGLNFGGSRFDATLQHDCSRVEAYRRFCGTRSMTIQSLIKRVCDLDRRVDDEDGSLYLRAVLVCVAHTLVLGLDTRVQPWLWVLVDDLATFDRFPWGAYSYKMLCHYTHEIGTSEKYHFYGPSWALYVWALERVLGFGHMVAASSGDPTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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