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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000775`

染色体: Chr02 坐标: 12722107-12723490 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000775`
名称	SmilChr02G000775
描述	uncharacterized SmilChr02G000775
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	12722107 - 12723490 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011251`
GeneID	`131011251`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011251`
原始查询	`SmilChr02G000775`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=27.6; qcov=0.831; evalue=1.71e-15; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=36.5; qcov=0.831; evalue=1.66e-33; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011251

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795021.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795021.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795021.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795021.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795021.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:12722709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,B96
`Chr2:12722738`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A15,A4,B10,B114,B126,B137,B38,B39,B45,B56,B59,B67,B72,B73,B77,B82,B87,B93,B96,C23,C24,C25,C34,C4,C44,C45,C46,C50,C51,C52,C57,C61,C67,C7,C79,C8,C82,C85,D3,D6,D9
`Chr2:12722747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B3,B93,C15
`Chr2:12722761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B70
`Chr2:12722837`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A11,B109,C32,C59,C68,D11
`Chr2:12722846`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A4,B106,B120,B25,B37,B47,B51,B61,B74,B78,B8,B81,B82,B90,B95,C17,C24,C34,C53
`Chr2:12722850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B13,B2,B83
`Chr2:12722871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B10,B101,B26
`Chr2:12722881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C87
`Chr2:12722881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:12722899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr2:12722929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B7,B93,C15,C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795021.1

231 aa

116

231

SWIM

PF04434 SWIM 64-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795021.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	64	92	2e-10	40.7	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939038.1
TTACCAAAGTAACAGGTGCTCTTCTTATATGGTTGACAATAACATAAGTGAAAGTTTCAATCTAATTTAGTAAATGCAAGGTACAAGCCTATTATAAGCATGTTAGAAGATATTAGAGAGATGGTGATGCTTAGGATTAAAGATAGAAAAAATTTATGTGACAGATGGATTGGTGAATGGTCACCTGCTGCTATGAAAACTTATCTTGAAGCCAAAGAGTGGGCAGTTGGGTGTAGGGTTCTTTGGAATGGTGAGTTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011251
ATGTTAGAAGATATTAGAGAGATGGTGATGCTTAGGATTAAAGATAGAAAAAATTTATGTGACAGATGGATTGGTGAATGGTCACCTGCTGCTATGAAAACTTATCTTGAAGCCAAAGAGTGGGCAGTTGGGTGTAGGGTTCTTTGGAATGGTGAGTTTGGCTATGAGGTTGGAGAGGGTAAAGATAAGCATACTGTATTTCTAGATAAGAAGTTCTGCACTTGTAGGAGGTGGGAACTGACTGGAATTCCATGTTGTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795021.1
MLEDIREMVMLRIKDRKNLCDRWIGEWSPAAMKTYLEAKEWAVGCRVLWNGEFGYEVGEGKDKHTVFLDKKFCTCRRWELTGIPCCHAIAAMCFSEIDPMSMILNWYHKSMYQKAYEYTIKPVPGVKFFKKELHAPIEPPPWEKMTGRPRKNRIRAQNEPSSSTRLSRKGQIQRCSICKDTGHKKTFCPTTLSQVIGKSQSSTSTRPTKMPVRRKTVGIGCHVNLSTGLFT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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