当前解析结果
SmilChr02G000779| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000779 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000779 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000779 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 12764242 - 12765276 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008012 |
|---|---|
| GeneID | 131008012 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008012 |
| 原始查询 | SmilChr02G000779 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008012 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790899.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057790899.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790899.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790899.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790899.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:12764283 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A19,B74 |
Chr2:12764302 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C2,C40 |
Chr2:12764349 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B18,B61,C48,C75,C83 |
Chr2:12764353 |
CGG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B18,B61,C48,C75,C83 |
Chr2:12764353 |
CGG |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | B18,B61,C48,C75,C83 |
Chr2:12764361 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B18,B61,C48,C75,C83 |
Chr2:12764362 |
T |
TTA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 5 | B18,B61,C48,C75,C83 |
Chr2:12764362 |
T |
TTA |
2bp_insertion | CDS_variant | 5 | B18,B61,C48,C75,C83 |
Chr2:12764370 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 57 | A1,A13,A15,A16,A2,A24,A3,A7,B106,B111,B112,B115,B119,B122,B129,B13,B131,B136,B140,B18,B19,B2,B35,B47,B49,B55,B56,B59,B63,B67,B77,B80,B86,B89,B91,B96,C1,C23,C27,C30,C35,C37,C4,C41,C47,C59,C61,C65,C71,C75,C76,C81,C83,C86,D10,D5,D8 |
Chr2:12764373 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 116 | A11,A16,A18,A19,A23,A4,A6,A7,A8,B1,B10,B101,B104,B105,B108,B110,B113,B12,B120,B121,B123,B124,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B134,B14,B140,B16,B18,B19,B20,B22,B23,B24,B25,B3,B31,B32,B36,B38,B40,B45,B49,B50,B51,B53,B57,B59,B6,B60,B62,B66,B7,B71,B72,B74,B75,B78,B79,B86,B87,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B98,B99,C10,C12,C13,C14,C16,C19,C2,C22,C25,C26,C28,C3,C31,C32,C34,C35,C38,C39,C41,C42,C46,C48,C49,C52,C56,C6,C60,C62,C65,C67,C68,C70,C75,C78,C8,C84,C85,C86,C87,D2,D5,D6,D7 |
Chr2:12764376 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B18,B61,C75,C83 |
Chr2:12764395 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B18,B61,C75 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。