当前解析结果
SmilChr02G000785| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000785 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000785 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000785 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 12901317 - 12902171 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008014 |
|---|---|
| GeneID | 131008014 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008014 |
| 原始查询 | SmilChr02G000785 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=29.2; qcov=0.94; evalue=6.69e-26; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008014 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057790902.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057790902.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057790902.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057790902.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790902.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:12901326 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B35,B64,C24 |
Chr2:12901328 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 21 | A14,A6,B103,B105,B108,B25,B32,B52,B66,B71,B73,B78,B97,B98,C10,C12,C16,C29,C32,C71,D3 |
Chr2:12901349 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C46 |
Chr2:12901349 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr2:12901379 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A6,B103,B105,B66,C10 |
Chr2:12901381 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B134,B45,B71,D11 |
Chr2:12901399 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B11,B133,B57,B88,C51,C77 |
Chr2:12901408 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B133,B16 |
Chr2:12901416 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:12901421 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B6 |
Chr2:12901424 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B6 |
Chr2:12901424 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。