当前解析结果
SmilChr02G000789| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000789 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000789 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000789 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 12985385 - 12986180 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011263 |
|---|---|
| GeneID | 131011263 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011263 |
| 原始查询 | SmilChr02G000789 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011263 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057795033.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057795033.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057795033.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795033.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795033.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:12985892 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,B104,C77,D10 |
Chr2:12985898 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr2:12985904 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C48,D11 |
Chr2:12985920 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:12985945 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B122,B22,B69,C11,C69 |
Chr2:12985970 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 25 | B126,B129,B131,B2,B20,B21,B30,B44,B53,B57,B63,B9,B94,C21,C35,C37,C38,C51,C56,C65,C67,C7,C73,C8,D3 |
Chr2:12985982 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B37,B76,C45,C7 |
Chr2:12985983 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:12985994 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,C8 |
Chr2:12985998 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:12986008 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B69,B78,C30,C40 |
Chr2:12986021 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A10,B110,B29,B31,B77,C29,C6,C79 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。