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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000791`

染色体: Chr02 坐标: 13046149-13051051 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000791`
名称	SmilChr02G000791
描述	uncharacterized SmilChr02G000791
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	13046149 - 13051051 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011265`
GeneID	`131011265`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011265`
原始查询	`SmilChr02G000791`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0128300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0128300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0128300` - identity=31.4; qcov=0.854; evalue=8.06e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011265

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795034.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795034.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795034.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795034.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795034.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:13047101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:13050201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A5,B128,B26,B56,B60,C32,C52,C57,C68,C84,D9
`Chr2:13050297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:13050314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,D11
`Chr2:13050319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:13050332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:13050348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B131
`Chr2:13050348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:13050355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B80,C42
`Chr2:13050364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,B84
`Chr2:13050463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B82,C28,C58,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795034.1

123 aa

123

Transpos_assoc

PF13963 Transpos_assoc 3-76 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795034.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	3	76	2.9e-23	82.6	Transposase-associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096826.1
ATTTATTTTTTTTCAAAATTTGCCTTACACGATTAGCCCTAGTTATCGCCCGACGCCCGTATAGCTTAAATTCCACTACAATTACAACTCAAACAATCTTTTGGAGTTAGAATGAACCAAGGAAGGCAGCTCAGCTCGTGAAGGGAAACCATCTAAATATACAATTGTTCATCAAAGACTCCCCTAAGCGCAAACCACTTTTTCCACCTCAATCCAGGTGTGAAGTTTGCTATGGATAAAAGTTGGATCAATCTCAATAA...

XR_009096825.1
AACATCTTTCCATAGTATAAATTAAATAAGAAAAAATAAGTGTCTTCTTCACTTTATTTTTTTCTCAATTACAGCTTAAATTCCACTACAATTACAACTCAAACAATCTTTTGGAGTTAGAATGAACCAAGGAAGGCAGCTCAGCTCGTGAAGGGAAACCATCTAAATATACAATTGTTCATCAAAGACTCCCCTAAGCGCAAACCACTTTTTCCACCTCAATCCAGGTGTGAAGTTTGCTATGGATAAAAGTTGGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011265
ATGGATAAAAGTTGGATCAATCTCAATAATAGACGGCTCCCTCAATATGAAGAAGGTGTTCGTCAATTCTTAAGTTTTGCATATGCTACTAAGGATGTACAAGAGAAGATTAGATGTCCTTGCAAAAGATGCAATAACGTTTTATACCAGAGTCGAGATGATGTTGAGGCTGATTTGTTACAGTACGGTTTTATTAAAGATTATGCCATATGGATGCTTCATGGGGAAGAACTTCCTGATTCTGATTCTGATGAGGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795034.1
MDKSWINLNNRRLPQYEEGVRQFLSFAYATKDVQEKIRCPCKRCNNVLYQSRDDVEADLLQYGFIKDYAIWMLHGEELPDSDSDEDEDEGMIDGHDINEGRENIAGADGYEFFDTQDMSRRRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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