当前解析结果
SmilChr02G000793| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000793 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000793 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000793 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 13079223 - 13080688 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011267 |
|---|---|
| GeneID | 131011267 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011267 |
| 原始查询 | SmilChr02G000793 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011267 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057795036.1 |
| 2 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.40000 | XP_057795036.1 |
| 3 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.40000 | XP_057795036.1 |
| 4 | Growth cone | Growth cone | 0.40000 | XP_057795036.1 |
| 5 | Pseudopodium | Pseudopodium | 0.40000 | XP_057795036.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:13079554 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr2:13079556 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,C23 |
Chr2:13079586 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A20,B29,B5,B52,B97 |
Chr2:13079616 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr2:13079619 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B137,D10 |
Chr2:13079673 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B137 |
Chr2:13079678 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B21,D4 |
Chr2:13079735 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B82,D2 |
Chr2:13079765 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B117,C23,D11 |
Chr2:13079786 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B88,C61,C72 |
Chr2:13079789 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B137,B29,B5,B97 |
Chr2:13079824 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。