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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr02G000793

染色体: Chr02 坐标: 13079223-13080688 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr02G000793
名称SmilChr02G000793
描述uncharacterized SmilChr02G000793
染色体 / SeqIDChr02 / NC_080388.1
坐标与链方向13079223 - 13080688 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131011267
GeneID131011267
locus_tag-
NCBI NameLOC131011267
原始查询SmilChr02G000793

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述confidence=no_hit
产物confidence=no_hit
Arabidopsis-
-
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131011267

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytosol 细胞质基质 1.00000 XP_057795036.1
2 Cytoskeleton 细胞骨架 0.40000 XP_057795036.1
3 Cell membrane 细胞膜 0.40000 XP_057795036.1
4 Growth cone Growth cone 0.40000 XP_057795036.1
5 Pseudopodium Pseudopodium 0.40000 XP_057795036.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr2:13079554 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B94
Chr2:13079556 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B117,C23
Chr2:13079586 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A20,B29,B5,B52,B97
Chr2:13079616 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B84
Chr2:13079619 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B137,D10
Chr2:13079673 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B137
Chr2:13079678 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B21,D4
Chr2:13079735 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B82,D2
Chr2:13079765 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B108,B117,C23,D11
Chr2:13079786 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B88,C61,C72
Chr2:13079789 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B137,B29,B5,B97
Chr2:13079824 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057939053.1
GATCACTGATCAAATGAGATGTAAATCTCCCAAGATTCCTTTAGTGCTCCCATCCCTCTCTACTTTTTCATAATTATTTTAATTTTGAAATAGCTGATTTACATTCCTATAAATACCTTCGCTAATAGCTTAGTTTCCACCATCAGATTAGCTAGCCAATACTCTCTGCTCTAAATTGGAAAGAGTTGTATATTCATTTCTTCCTCCACACACCATAATTTTGAGAAAACAATGGCTACAGCTGAGGTTCAATCAGCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131011267
ATGGCTACAGCTGAGGTTCAATCAGCACCAGCGCCAGTCCCGGAGACTCTACCGAAGGAGGAAGTGATCGCCACGGCGGAGCAAGAGACGGCGGTGGCGACGAAGGTTCTGGCAGCGGCGATTGCCGAAGCAGCACCGCAGGAAGCAGCTGAAGAAGTTGCTCCAGTAGAGAAACCAGTTGCGCCGGAGACCGAGCCGCCGGCTCCAGAAGCCGAGCCTGAGGAAGTTCCGGCGGAAGAGCCAGCCGCTGAGACCGCGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057795036.1
MATAEVQSAPAPVPETLPKEEVIATAEQETAVATKVLAAAIAEAAPQEAAEEVAPVEKPVAPETEPPAPEAEPEEVPAEEPAAETATPEDSAEEAKEEVPEKPAAEEEETSEKPEAEVEGEAEAAAPAEEAAAEAAPADEVKQPAEEVAVVKSEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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