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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr02G000808

染色体: Chr02 坐标: 13535231-13539747 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr02G000808
名称SmilChr02G000808
描述mitochondrial pyruvate carrier 4-like
染色体 / SeqIDChr02 / NC_080388.1
坐标与链方向13535231 - 13539747 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131011278
GeneID131011278
locus_tag-
NCBI NameLOC131011278
原始查询SmilChr02G000808

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述mitochondrial pyruvate carrier 4-like
产物mitochondrial pyruvate carrier 4-like
ArabidopsisAT4G22310 (AT4G22310)
Uncharacterized protein family (UPF0041) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828326]
identity=79.6; qcov=1; evalue=2.57e-63; confidence=high
RiceOs07g0449100 (OJ1047_A06.120)
-
identity=79.8; qcov=0.963; evalue=8.33e-62; confidence=high
GOGO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0006850 (pyruvate import into mitochondria)
KEGG-
PfamPF03650 (MPC)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131011278

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Mitochondrion 线粒体 1.00000 XP_057795050.1
2 Mitochondrion membrane 线粒体膜 1.00000 XP_057795050.1
3 Mitochondrion inner membrane 线粒体内膜 1.00000 XP_057795050.1
4 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057795050.1
5 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057795050.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795050.1
108 aa
N
1
54
108
MPC
C
PF03650 MPC 3-103 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057795050.1 Pfam PF03650 MPC Repeat 3 103 4.7e-38 130.8 Mitochondrial pyruvate carriers

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057939067.1
AAGGATAAAAATATGAATGCAACACCCATATAAAATGATTCTGCCAATTCAGTAGCCAACGACGCACACAGTCACAAATACTCTCGTACAGAAGAAAAAAGAAGAATTTCAATGGCGAGTTCAAAATTTCAAGCTCTATGGAATCACCCAGCTGGCCCTAAAACCATTCATTTCTGGGCACCGACCTTCAAATGGGGAATTAGCATTGCTAATCTAGCTGATTCAACTAAACCCCCTGAGAAAGTTTCATATCCCCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131011278
ATGGCGAGTTCAAAATTTCAAGCTCTATGGAATCACCCAGCTGGCCCTAAAACCATTCATTTCTGGGCACCGACCTTCAAATGGGGAATTAGCATTGCTAATCTAGCTGATTCAACTAAACCCCCTGAGAAAGTTTCATATCCCCAACAGATAGCTGTTACAGCAACTGGAGTTATTTGGTCGCGCTATAGCACTGTTATTACTCCTAAGAACTGGAATCTCTTTAGTGTAAACATTGTAATGGCCGGCACAGGCATTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057795050.1
MASSKFQALWNHPAGPKTIHFWAPTFKWGISIANLADSTKPPEKVSYPQQIAVTATGVIWSRYSTVITPKNWNLFSVNIVMAGTGIYQLSRKIQHDYFSKEQSVVAKE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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