当前解析结果
SmilChr02G000811| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000811 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000811 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000811 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 13604398 - 13606703 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008021 |
|---|---|
| GeneID | 131008021 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008021 |
| 原始查询 | SmilChr02G000811 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008021 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057790908.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057790908.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.60000 | XP_057790908.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057790908.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057790908.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:13604526 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C56 |
Chr2:13604555 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B72,C3 |
Chr2:13604574 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A21,A24,A7,B10,B94,C3,C41 |
Chr2:13604615 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 52 | A23,A8,B102,B106,B117,B118,B124,B126,B128,B129,B137,B16,B18,B21,B24,B27,B31,B5,B54,B55,B56,B6,B62,B77,B83,B88,B90,B94,C13,C14,C23,C25,C27,C31,C33,C34,C37,C42,C44,C45,C47,C50,C55,C57,C60,C61,C64,C66,C75,C78,C8,C83 |
Chr2:13604646 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A22,B65,C87 |
Chr2:13604677 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B17,B30 |
Chr2:13604678 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C24 |
Chr2:13604717 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C18 |
Chr2:13604749 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B120,B30,B84,C50 |
Chr2:13604760 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,B90 |
Chr2:13604773 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B10,B137,B88,C75 |
Chr2:13604802 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,B58,B65,B98,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。