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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000842`

染色体: Chr02 坐标: 14322299-14325213 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000842`
名称	SmilChr02G000842
描述	chromatin remodeling protein EBS-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	14322299 - 14325213 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011307`
GeneID	`131011307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011307`
原始查询	`SmilChr02G000842`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chromatin remodeling protein EBS-like
产物	chromatin remodeling protein EBS-like
Arabidopsis	`AT4G22140` (EBS) PHD finger family protein / bromo-adjacent homology (BAH) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828303] identity=68.8; qcov=1.11; evalue=2.12e-112; confidence=high
Rice	`Os08g0421900` - identity=68.1; qcov=1.07; evalue=7.03e-110; confidence=high
GO	GO:0003682 (chromatin binding)
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD); PF01426 (BAH); PF30811 (PHD_UBR7-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795066.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057795066.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057795066.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057795066.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057795067.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:14323803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B8,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795066.1

212 aa

106

212

BAH

PHD_UBR7-like

PHD

PF01426 BAH 23-134 aa PF30811 PHD_UBR7-like 139-185 aa PF00628 PHD 141-184 aa

XP_057795067.1

202 aa

101

202

BAH

PHD_UBR7-like

PHD

PF01426 BAH 25-124 aa PF30811 PHD_UBR7-like 129-175 aa PF00628 PHD 131-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795066.1`	Pfam	`PF01426`	BAH	Domain	23	134	1.9e-24	86.6	BAH domain
`XP_057795066.1`	Pfam	`PF30811`	PHD_UBR7-like	Domain	139	185	1.5e-08	35.2	UBR7-like PHD finger
`XP_057795066.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	141	184	1.2e-08	35.5	PHD-finger
`XP_057795067.1`	Pfam	`PF01426`	BAH	Domain	25	124	2e-20	73.6	BAH domain
`XP_057795067.1`	Pfam	`PF30811`	PHD_UBR7-like	Domain	129	175	1.4e-08	35.3	UBR7-like PHD finger
`XP_057795067.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	131	174	1.1e-08	35.6	PHD-finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096859.1
CCCATTGACAGTGCCTAACCTCAAAAAGCTGTAGTGCTACAAATGACATCTCTGCATATCATTAATGACTGCAGCAGAACGGTTTAAGAACTCTAAATCAGGATTAGTTCTCATAATTAATTCTTAAAATTGTAGTTTCACACCATTTTTAATACTCCAAAATTATACTCATTTCCCCCAATAAATACCATTTGAATACGGACAAAGCAGTGCTCTCTTAGGGTTTGTTTTAACCGCAAATTTTACCCCCCAAAAGTTCT...

XM_057939083.1
CCCATTGACAGTGCCTAACCTCAAAAAGCTGTAGTGCTACAAATGACATCTCTGCATATCATTAATGACTGCAGCAGAACGGTTTAAGAACTCTAAATCAGGATTAGTTCTCATAATTAATTCTTAAAATTGTAGTTTCACACCATTTTTAATACTCCAAAATTATACTCATTTCCCCCAATAAATACCATTTGAATACGGACAAAGCAGTGCTCTCTTAGGGTTTGTTTTAACCGCAAATTTTACCCCCCAAAAGTTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011307
ATGGCGAAAACGAGACCTGGAAAGAGAGATGTAGATTCTTACACAATTAGAGGCACCAACAAAGTTGTTAAAGAAAGTAACACCGCGCCTTATGTGGCACGGGTGGAGAAGATTGAGGCTGATAACCGTAACAATATGAAAGTCCGGGTGAGGTGGTACTACAGGCCAGAGGAAGCAGTCGGAGGAAGAAGACAGTTCCATGGAGCCAAGGAATTGTTCTTATCAGATCACCATGACACACAGAGTGCTCACACTATCGA...

LOC131011307
ATGGCGAAAACGAGACCTGGAAAGAGAGATGTAGATTCTTACACAATTAGAGGCACCAACAAAGTTGTTAAAGCTGGAGATTGTGTCTTGATGCGGCCATCAGAAAGTAACACCGCGCCTTATGTGGCACGGGTGGAGAAGATTGAGGCTGATAACCGTAACAATATGAAAGTCCGGGTGAGGTGGTACTACAGGCCAGAGGAAGCAGTCGGAGGAAGAAGACAGTTCCATGGAGCCAAGGAATTGTTCTTATCAGATCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795066.1
MAKTRPGKRDVDSYTIRGTNKVVKAGDCVLMRPSESNTAPYVARVEKIEADNRNNMKVRVRWYYRPEEAVGGRRQFHGAKELFLSDHHDTQSAHTIEGKCIVHSFKNYTKLQNVGPEDYYCRFEYKPATGAFLPDRVAVYCKCEMPYNPDDLMIQCDECKDWYHPACVDMTVEQAKQLDHFICAEHGSDEDVKKLQETSLTNGKAETKRQRK

XP_057795067.1
MAKTRPGKRDVDSYTIRGTNKVVKESNTAPYVARVEKIEADNRNNMKVRVRWYYRPEEAVGGRRQFHGAKELFLSDHHDTQSAHTIEGKCIVHSFKNYTKLQNVGPEDYYCRFEYKPATGAFLPDRVAVYCKCEMPYNPDDLMIQCDECKDWYHPACVDMTVEQAKQLDHFICAEHGSDEDVKKLQETSLTNGKAETKRQRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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