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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000858`

染色体: Chr02 坐标: 14717713-14721808 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000858`
名称	SmilChr02G000858
描述	zinc transporter 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	14717713 - 14721808 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011319`
GeneID	`131011319`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011319`
原始查询	`SmilChr02G000858`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc transporter 1-like
产物	zinc transporter 1-like
Arabidopsis	`AT3G12750` (ZIP1) zinc transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820457] identity=55; qcov=0.884; evalue=7.72e-121; confidence=high
Rice	`Os07g0232800` (OsZIP8) - identity=53; qcov=0.836; evalue=1.72e-106; confidence=high
GO	GO:0005385 (zinc ion transmembrane transporter activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0071577 (zinc ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF02535 (Zip)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011319

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057795086.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795086.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795086.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795086.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795086.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:14717952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B136,B55,B94
`Chr2:14718046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:14718051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:14718138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:14721065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C65
`Chr2:14721071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr2:14721264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C49
`Chr2:14721313`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A19,B18,B26,B62,C16,C56,D2
`Chr2:14721432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B66,C39
`Chr2:14721552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795086.1

372 aa

186

372

Zip

PF02535 Zip 89-369 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795086.1`	Pfam	`PF02535`	Zip	Family	89	369	2.5e-68	231.4	ZIP Zinc transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939103.1
TCATTATGAAAAGTGGAACATTTGTAATGAAACGAAGGGAGTAATAAATTGGACTCCTTTCTTCATTTCTAATATACTTATCTAATACACTTTTTATAGGACAGAGAGATTATTATATATATATATATATATAAGTTGCCATGCTCCTTTTCCTTATCAGACATGCATTTCTTTCCTGCATTTTGGAGGCATCCGCACCTAACGACCCAGCGCCCGTTGAAAAAAATGCAATCATATTTCTTTTGAAAACACCACCCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011319
ATGCTCCTTTTCCTTATCAGACATGCATTTCTTTCCTGCATTTTGGAGGCATCCGCACCTAACGACCCAGCGCCCGTTGAAAAAAATGCAATCATATTTCTTTTGAAAACACCACCCCTTCCCTCGCGGAGCTTCTCCGCCATGGCCACTGCTCATAAAATAATGTTCCTCACAGTCATCGCGGTCTCAGCCATCGCAGTAGCGGCTGCAGAAGACTGCACGACCCACGCCGCCGACGCGGAGCAAGGCAACAAGAGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795086.1
MLLFLIRHAFLSCILEASAPNDPAPVEKNAIIFLLKTPPLPSRSFSAMATAHKIMFLTVIAVSAIAVAAAEDCTTHAADAEQGNKSEALKLKLVAIASILTAGGVGVSFPLLGRKLPALRPENDIFLMVKAFAGGVVLATGFVHILPDAFRSLTSPCISHTPWAQFPFSGFIAMAAAIATLMVDTIATAFYRNTHSSKAAADEEAAGDADRRPSDILRQRIISQVLEVGMVVHSVVIGISVGVSRSPGNIKPLLIALSFH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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