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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000860`

染色体: Chr02 坐标: 14764178-14776576 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000860`
名称	SmilChr02G000860
描述	uncharacterized SmilChr02G000860
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	14764178 - 14776576 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011320`
GeneID	`131011320`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011320`
原始查询	`SmilChr02G000860`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0233400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0233400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G12760` (AT3G12760) defective in cullin neddylation protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820458] identity=74; qcov=0.965; evalue=1.05e-144; confidence=high
Rice	`Os06g0233400` - identity=74.5; qcov=0.969; evalue=9.89e-149; confidence=high
GO	GO:0000151 (ubiquitin ligase complex); GO:0031624 (ubiquitin conjugating enzyme binding); GO:0032182 (ubiquitin-like protein binding); GO:0045116 (protein neddylation); GO:0051443 (positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity); GO:0097602 (cullin family protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF03556 (Cullin_binding); PF14555 (UBA_4); PF22566 (UBA_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011320

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795087.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795087.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057795087.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057795087.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795087.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:14765383`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C25
`Chr2:14765383`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C25
`Chr2:14767029`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C46
`Chr2:14767029`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C46
`Chr2:14770241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B53
`Chr2:14775280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B34,C20,C35,C77
`Chr2:14775322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D4
`Chr2:14775980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B54,B83,B93,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795087.1

259 aa

130

259

UBA_8

UBA_4

Cullin_binding

PF22566 UBA_8 8-45 aa PF14555 UBA_4 10-47 aa PF03556 Cullin_binding 130-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795087.1`	Pfam	`PF22566`	UBA_8	Domain	8	45	7.4e-12	45.6	UBA-like domain
`XP_057795087.1`	Pfam	`PF14555`	UBA_4	Domain	10	47	4.4e-12	46.3	UBA-like domain
`XP_057795087.1`	Pfam	`PF03556`	Cullin_binding	Family	130	240	9.6e-38	129.9	Cullin binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939104.1
ATATTCAAAAGTGATCAATGATCTACTCTTGTGAGGGGCCTACCAAGCGCGAGCCTTCCACTGGTGGTGGTGCTGATTTGGTTCTGAGCGAAGACTGAAGATACACTAGAGAAGGAATCCGTCTACCAAAAGGAAGAAAACATAGATTTATAGTAAAAAAAGAGACAATAGGAATACTGTGGGCGGCTTGGAGTGAGAAATTCTTCCGATTAATTGTAACCCTAGCTCGTCTTCGCGTGTTCCGGTCACAGCCTTTGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011320
ATGAACAAGCTGGGCAGAGGGCAGCGGGACAAAGTACAACAGTTCATGTCTATTACTGGGGCGAGTGAAAAAGTTGCTGTCCAAGCATTGAAGGCTAGTGATTGGCAATTTGAAGGAGCGTTCGACATATTCTATAGCCATTCCCACGTAAAGTCTGTTGCTGACACTAGGCATTTAGAGGAGCTCTACAATAGATACAAAGATCCCTATGCTGATATGATTTTGGTTGATGGAATTACCCTCCTATGCAATGACCTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795087.1
MNKLGRGQRDKVQQFMSITGASEKVAVQALKASDWQFEGAFDIFYSHSHVKSVADTRHLEELYNRYKDPYADMILVDGITLLCNDLQVDPQDIVMLVVSWHMKAATMCEFSKQEFITGLQSLGIDSLEKFRERIPFMRSELKDEQKFREIYNYAFGWAKEKGQKSLALDTAIGMWQLLFAEKQWPLVDHWCQFLQARHNKAISRDTWSQLLEFARIVDPALSNYDPEGAWPYLIDEFVDYLTEYGIIQKGKLSDWSYKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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