当前解析结果
SmilChr02G000863| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000863 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000863 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000863 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 14819324 - 14819936 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008035 |
|---|---|
| GeneID | 131008035 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008035 |
| 原始查询 | SmilChr02G000863 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008035 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790922.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057790922.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057790922.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057790922.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790922.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:14819338 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,A21,B28,B65,D5 |
Chr2:14819342 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B76 |
Chr2:14819353 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,B106,C71,D2 |
Chr2:14819355 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B101,D2 |
Chr2:14819363 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,C48 |
Chr2:14819391 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B100,B132,B135,C15 |
Chr2:14819391 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | B100,B132,B135,C15 |
Chr2:14819402 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B95,B99,C66 |
Chr2:14819411 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C75 |
Chr2:14819426 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C66 |
Chr2:14819428 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C6,D6 |
Chr2:14819430 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C48,C6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。