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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000872`

染色体: Chr02 坐标: 15011322-15014971 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000872`
名称	SmilChr02G000872
描述	uncharacterized SmilChr02G000872
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	15011322 - 15014971 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008038`
GeneID	`131008038`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008038`
原始查询	`SmilChr02G000872`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF31073 (DUF8803)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008038

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790924.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057790924.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057790924.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790924.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790924.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:15011444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:15011474`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B93,C5
`Chr2:15011474`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B93,C5
`Chr2:15011534`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B115,B127,B20,B50,C1,C13,D11
`Chr2:15011580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:15011598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C4
`Chr2:15011659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:15011660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:15011707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B41,B71,B98,C10
`Chr2:15011767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B126,B47,B93
`Chr2:15011768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B56,B96
`Chr2:15011815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B124,B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790924.1

263 aa

132

263

DUF8803

PF31073 DUF8803 212-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790924.1`	Pfam	`PF31073`	DUF8803	Domain	212	262	2.8e-13	50.2	Domain of unknown function (DUF8803)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934941.1
ATGTCGCGCGAGATCAAGACAACGCTGTTGTACTTCTACTTTCTGATCCAAGGATGCAGATACTCTTCAAGGGAAACTAGAGCCTCGAGAGGGCAGCACAGGTTCAAAGAACACAAGCGGGCACTTCGTCAGTTCGCTGCTGCGCTGATGTATGGAGTACCAAGGGTCCTGGTCTCAGACAATGGGACTCAATTCACAAACAAAAGGATAGAAGATTTTTGCTCGCGCATGGATATCATTCAAAGATTCGTATCAGTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008038
ATGTCGCGCGAGATCAAGACAACGCTGTTGTACTTCTACTTTCTGATCCAAGGATGCAGATACTCTTCAAGGGAAACTAGAGCCTCGAGAGGGCAGCACAGGTTCAAAGAACACAAGCGGGCACTTCGTCAGTTCGCTGCTGCGCTGATGTATGGAGTACCAAGGGTCCTGGTCTCAGACAATGGGACTCAATTCACAAACAAAAGGATAGAAGATTTTTGCTCGCGCATGGATATCATTCAAAGATTCGTATCAGTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790924.1
MSREIKTTLLYFYFLIQGCRYSSRETRASRGQHRFKEHKRALRQFAAALMYGVPRVLVSDNGTQFTNKRIEDFCSRMDIIQRFVSVAHLQANGQVELATCTVCEGIKKRLEKSKGRWAEELDTVLWALRTSPKTATGEALFTLVYGSNAVIPAEIRLESHRVINYEPTQNEEIRRLDLDMVELKREEAQVRAAKYKSIIKAEYDRKVRQRRFWKGDLELKRADVLKPMGKFESNWEGPFIITEVLGGGAYHLSDQNGRPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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