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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000873`

染色体: Chr02 坐标: 15058439-15063644 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000873`
名称	SmilChr02G000873
描述	uncharacterized SmilChr02G000873
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	15058439 - 15063644 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011326`
GeneID	`131011326`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011326`
原始查询	`SmilChr02G000873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0664400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0664400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0664400` - identity=57.2; qcov=0.411; evalue=1.15e-64; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30850 (DUF8750)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011326

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057795091.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795091.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795091.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795091.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795091.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:15058606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,B98,C10,C62
`Chr2:15058620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B114,B117,C23
`Chr2:15058639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:15058666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr2:15058716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:15058721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,B98,C10,C62
`Chr2:15058722`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B23,B4,B50,B66,C27,C44
`Chr2:15058724`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B23,B4,B50,B66,C27,C44
`Chr2:15058762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:15058873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B66
`Chr2:15058886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B13
`Chr2:15059016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795091.1

455 aa

228

455

DUF8750

PF30850 DUF8750 391-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795091.1`	Pfam	`PF30850`	DUF8750	Domain	391	455	3.9e-39	133.2	Domain of unknown function (DUF8750)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939108.1
AATCAAATTATTGTACAATTGAAACGAAGAAGCGAGTAAAAAATTTAAACTTGAGTTAACCAAAAATGAGAAGAAATCCCCAAATACACATAACCTAGTGCCACTCGACACCACTACGCTGTGTTGCGAAATCCCCCAAACAATATGAGAAGAAGCATCTCCAAAATCCCTTACCGCCCTGCCACCGCCACGTCCTCGATCGCCGCCTCTCTATCCACCTCGTCAGGCGGCGGAGGTAGAGGCCGTGGCCGTGGCGGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011326
ATGAGAAGAAGCATCTCCAAAATCCCTTACCGCCCTGCCACCGCCACGTCCTCGATCGCCGCCTCTCTATCCACCTCGTCAGGCGGCGGAGGTAGAGGCCGTGGCCGTGGCGGTCCTACTCAATTCCAGTTCACCGTCGACACCCCACCCAAGGACGAGTCCAAATATTCCAACCACGACGGCGCGTCTCCGCTCCCGCACGGCCATGGTCGAGGCAGAGGTGTTCCCGTTGCTTCATCCTCCGTTCCGCCTGCCTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795091.1
MRRSISKIPYRPATATSSIAASLSTSSGGGGRGRGRGGPTQFQFTVDTPPKDESKYSNHDGASPLPHGHGRGRGVPVASSSVPPAFSSFVNNESNSDAFGRGRGIGFVSPNSFSQPGEEFQPQPPKYNSQMPFLSKYEEALSDSAESEVPPADIKSTPSSIFNILSGAGRGKPGQSPASQSEKPKAEIRQARPREQRGTVGEQLSEEEKVRKAVGILSKGQVGGGSGGPEGRAERFEGGRGRGRGSGRGRGRETGVERGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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