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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000875`

染色体: Chr02 坐标: 15075885-15078085 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000875`
名称	SmilChr02G000875
描述	uncharacterized SmilChr02G000875
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	15075885 - 15078085 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008039`
GeneID	`131008039`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008039`
原始查询	`SmilChr02G000875`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=25.8; qcov=0.658; evalue=1.99e-40; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=32.5; qcov=0.837; evalue=9.09e-70; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008039

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790925.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790925.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790925.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790925.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790925.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:15075891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A1,A24,A9,B131,B41,B42,B43,B71,B98,C10,C50,C59,C62,C81,D10
`Chr2:15075919`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	47	A1,A16,A20,A24,A25,A9,B121,B128,B13,B20,B22,B24,B41,B42,B43,B49,B52,B60,B61,B71,B72,B73,B79,B81,B82,B86,B89,B98,C10,C19,C29,C30,C31,C36,C37,C40,C50,C52,C59,C62,C63,C75,C8,C81,C85,D10,D8
`Chr2:15075941`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr2:15075941`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr2:15075984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B8
`Chr2:15076023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B131,B42,B43,C50
`Chr2:15076037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B8
`Chr2:15076052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A3,B109,B11,B120,B133,B138,B139,B46,B54,B57,B88,B91,C15,C51,C54,C57,C77,D6
`Chr2:15076064`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	81	A13,A14,A16,A20,A21,A5,A7,A9,B1,B102,B105,B107,B109,B111,B112,B114,B118,B120,B123,B125,B127,B13,B130,B133,B136,B137,B138,B15,B18,B2,B3,B32,B36,B38,B39,B4,B41,B42,B49,B52,B59,B61,B64,B66,B82,B86,B97,B98,C10,C11,C12,C19,C20,C21,C26,C27,C30,C31,C32,C33,C40,C43,C46,C49,C53,C54,C59,C6,C64,C65,C66,C68,C70,C73,C74,C81,C82,C83,C85,D3,D9
`Chr2:15076070`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	87	A13,A14,A16,A20,A21,A4,A5,A7,A9,B1,B102,B105,B107,B109,B111,B112,B114,B118,B120,B123,B125,B127,B13,B130,B132,B133,B136,B137,B138,B15,B18,B2,B3,B32,B36,B38,B39,B4,B41,B42,B49,B52,B59,B61,B64,B66,B73,B77,B78,B82,B86,B97,B98,C10,C11,C12,C19,C20,C21,C26,C27,C30,C31,C32,C33,C40,C43,C46,C49,C53,C54,C59,C6,C64,C65,C66,C68,C70,C73,C74,C78,C81,C82,C83,C85,D3,D9
`Chr2:15076075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:15076087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B37,B6,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790925.1

596 aa

298

596

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 149-244 aa PF00872 Transposase_mut 166-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790925.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	149	244	1.1e-15	58.4	MULE transposase domain
`XP_057790925.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	166	248	6.7e-05	22.7	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934942.1
ATGTTAGTTTCTAAGGATGGGGATAATGGTGGACTAACCATCAAGACTTTATTCATGGAGCACTACTATTTCAGACAAAGAGAAATTCCAAGTTTAAGACAGTCATATCTTGCCAATTACTTCAAGGACAACATCTACAAGAATCCCAAATTCACAACAAAGGATATGCAAAATGAGGTGAGGAAGCATTTGAAATTGAAGGTCAGTCACTACAAATGCATAAGGGCAAAACACATTGTGATTACAGAATTGAAGGGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008039
ATGTTAGTTTCTAAGGATGGGGATAATGGTGGACTAACCATCAAGACTTTATTCATGGAGCACTACTATTTCAGACAAAGAGAAATTCCAAGTTTAAGACAGTCATATCTTGCCAATTACTTCAAGGACAACATCTACAAGAATCCCAAATTCACAACAAAGGATATGCAAAATGAGGTGAGGAAGCATTTGAAATTGAAGGTCAGTCACTACAAATGCATAAGGGCAAAACACATTGTGATTACAGAATTGAAGGGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790925.1
MLVSKDGDNGGLTIKTLFMEHYYFRQREIPSLRQSYLANYFKDNIYKNPKFTTKDMQNEVRKHLKLKVSHYKCIRAKHIVITELKGSFKQEFADLPAYIQVVKTSNPGTLCEVQLSEEGRENGIRVFKRIFVMFEACRRNWIEGCRPIISLDGCHLKGVCQGILLTAVMRDGNDGVVPIAWAIVSKENKNNWNWFLCWLRQELNLENGSTITIVSDMQKGITDAVQTTLSNAEHRWCARHIYANWSKKWRGTELKKHFWI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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