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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000883`

染色体: Chr02 坐标: 15222287-15225194 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000883`
名称	SmilChr02G000883
描述	NAC domain-containing protein JA2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	15222287 - 15225194 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011333`
GeneID	`131011333`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011333`
原始查询	`SmilChr02G000883`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAC domain-containing protein JA2-like
产物	NAC domain-containing protein JA2-like
Arabidopsis	`AT3G04070` (NAC047) NAC domain containing protein 47 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819562] identity=57.1; qcov=0.355; evalue=1.22e-56; confidence=low
Rice	`Os11g0184900` (NAC5) - identity=59.5; qcov=0.348; evalue=1.78e-55; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011333

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795096.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795096.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795096.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795096.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795096.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:15222576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:15222582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B3,C20,C35,C76,C77
`Chr2:15222582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,C20,C35,C76,C77
`Chr2:15222597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C30
`Chr2:15222607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B15,B23,C80
`Chr2:15222613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B100,B2,C27
`Chr2:15222616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B66
`Chr2:15222625`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B33,B82,C60
`Chr2:15222625`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B33,B82,C60
`Chr2:15222683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,A23
`Chr2:15222690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr2:15222690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795096.1

454 aa

227

454

NAM

PF02365 NAM 33-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795096.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	33	157	4.1e-43	147.5	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939113.1
TTTCACACTCTCTCCCAAGACTTCCCACCATCACCACCATGGATGATCAAGAAACAGAGCAGCGCCACTCCGAAGATGAACAAATTCCGGCACCGGCAGCTCCAATGGCCGTGCCGGAGTGGAAGAATTACCTGCCGGGGTTTCGTTTCGTGCCCACTGACACCGAGCTCATTCTGTATTACTTGCAGAAGAAAATCAACAATGAGCCTATCCTCTGTGATGGAATTAAAGACACTAATCTCAAACAAGTTAACCCCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011333
ATGGATGATCAAGAAACAGAGCAGCGCCACTCCGAAGATGAACAAATTCCGGCACCGGCAGCTCCAATGGCCGTGCCGGAGTGGAAGAATTACCTGCCGGGGTTTCGTTTCGTGCCCACTGACACCGAGCTCATTCTGTATTACTTGCAGAAGAAAATCAACAATGAGCCTATCCTCTGTGATGGAATTAAAGACACTAATCTCAAACAAGTTAACCCCTGGGACTTGCAAGCGAAGTTTCCGAAACTTGGAGACGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795096.1
MDDQETEQRHSEDEQIPAPAAPMAVPEWKNYLPGFRFVPTDTELILYYLQKKINNEPILCDGIKDTNLKQVNPWDLQAKFPKLGDDEWYFFTPRDRKYPNGERPDRGSESGYWKATGADKPVIVGDVTVGFKKALVFYQGKPQKGVKTNWIMHEYRVNAAARKKRSKDDMRLDDWVLCRMYEKSTRLTNKRKNPNAKEQTDDDWETAPLENDDDCEIAAAVENLPGIFPENPYPFNYYYHEQNPAYLQDILKQSTFAGYQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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