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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000894`

染色体: Chr02 坐标: 15389030-15392007 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000894`
名称	SmilChr02G000894
描述	uncharacterized SmilChr02G000894
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	15389030 - 15392007 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011341`
GeneID	`131011341`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011341`
原始查询	`SmilChr02G000894`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820449]; symbol=AT3G12685; hit=AT3G12685; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820449]; symbol=AT3G12685; hit=AT3G12685; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G12685` (AT3G12685) Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820449] identity=47.3; qcov=0.835; evalue=6.02e-59; confidence=high
Rice	`Os06g0530300` - identity=42.5; qcov=0.654; evalue=1.89e-30; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02681 (DUF212)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011341

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795109.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057795109.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057795109.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795109.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795109.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:15389258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B51,C25
`Chr2:15391617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:15391653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:15391659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B32,B75,C22,C87
`Chr2:15391702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B40,B69
`Chr2:15391752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C27,C44
`Chr2:15391806`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C81
`Chr2:15391806`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C81
`Chr2:15391810`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C81
`Chr2:15391810`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795109.1

266 aa

133

266

DUF212

PF02681 DUF212 58-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795109.1`	Pfam	`PF02681`	DUF212	Family	58	258	1.3e-36	126.2	Divergent PAP2 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939126.1
ATCGAGCGTTATCTCGTAATAAAAAGAAAAACAATCCTAGCAATTAATAATTCAGACCAACAAACAACCGCAGCTCCCTCGTTGAATTACTTGAATATGAAAGCGAGCTCGCAAAGAAAAAACTCATACCAAATTCATTCATTCATTCAATTATGATACTCCAATTTCTTAATTTCGGCGGCGCCGGACGCCTCCACTTTCTCAACCTCCGAAACCCCCAAAACGCCCCTTTCTCCACAACAACTCCCATCTCCTGCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011341
ATGATACTCCAATTTCTTAATTTCGGCGGCGCCGGACGCCTCCACTTTCTCAACCTCCGAAACCCCCAAAACGCCCCTTTCTCCACAACAACTCCCATCTCCTGCTCCTCCTCTTCTTCAATCCGTTGTGTCACCGGCAACGGTTTCCCGGCCCACGACATCGGCGCTATTTTGCACAACAAAGTTCTTGTATCAGCAGTTGCCTCTGCGGCAGTTGGGCAGTTGACCAAACCGTTTGCTTCGACCATTTTATACGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795109.1
MILQFLNFGGAGRLHFLNLRNPQNAPFSTTTPISCSSSSSIRCVTGNGFPAHDIGAILHNKVLVSAVASAAVGQLTKPFASTILYGKKFDLKTVFSSGGFPSTHSSSVVATATCLGIERGFADALFGLAVVYAGLIMYDAQGVRREVGTHAKLLNKVMPRTRLYTPSSSTDDANDVINSYSRESSSDLEITDPVLSEEYSSLQKSSLLLESDNRMRVRSSSVVSDICAGSESVASSLKESVGHTEIEVAAGAFLGLVVSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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