当前解析结果
SmilChr02G000905| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000905 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000905 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000905 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 15619672 - 15620148 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008049 |
|---|---|
| GeneID | 131008049 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008049 |
| 原始查询 | SmilChr02G000905 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008049 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790935.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057790935.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790935.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790935.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790935.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:15619678 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr2:15619681 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A8,B29 |
Chr2:15619752 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 16 | A2,A21,A7,B10,B11,B138,B4,B43,B60,C13,C45,C56,C72,C75,C83,D10 |
Chr2:15619811 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B55,C80 |
Chr2:15619813 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B55,C80 |
Chr2:15619814 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B139,B15 |
Chr2:15619855 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B114,C83 |
Chr2:15619903 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B114,C83 |
Chr2:15619976 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B70 |
Chr2:15619983 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B28,B35,B72 |
Chr2:15620008 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B118,B57,B71 |
Chr2:15620013 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,B84,C16 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。