当前解析结果
SmilChr02G000934| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000934 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000934 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000934 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 16267483 - 16270555 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011369 |
|---|---|
| GeneID | 131011369 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011369 |
| 原始查询 | SmilChr02G000934 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011369 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795156.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.80000 | XP_057795156.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057795156.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795156.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057795156.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:16267963 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B66,C10,C35,C76 |
Chr2:16268636 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,B38,C31 |
Chr2:16268856 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr2:16269517 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B140,D9 |
Chr2:16269517 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B140,D9 |
Chr2:16269526 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 25 | A19,A23,B112,B16,B18,B26,B48,B70,B76,B77,B99,C13,C16,C39,C53,C55,C56,C62,C64,C66,C70,C78,D2,D6,D7 |
Chr2:16269538 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D9 |
Chr2:16269547 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D9 |
Chr2:16269573 |
G |
GAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B7,C80 |
Chr2:16269573 |
G |
GAT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B7,C80 |
Chr2:16269616 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D10 |
Chr2:16269616 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。