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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000955`

染色体: Chr02 坐标: 16595393-16597882 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000955`
名称	SmilChr02G000955
描述	uncharacterized SmilChr02G000955
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	16595393 - 16597882 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008062`
GeneID	`131008062`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008062`
原始查询	`SmilChr02G000955`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G51700` (AT3G51700) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333] identity=33.7; qcov=0.665; evalue=4.44e-29; confidence=low
Rice	`Os04g0357300` - identity=38.6; qcov=1; evalue=6.73e-43; confidence=medium
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008062

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790946.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057790946.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790946.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790946.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790946.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:16595407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B125,B24,C39,C61
`Chr2:16595414`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A21,B78
`Chr2:16595414`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A21,B78
`Chr2:16595417`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C58
`Chr2:16595417`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C58
`Chr2:16595419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:16595431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:16595446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr2:16595454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,C45,D11
`Chr2:16595471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr2:16595544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C5
`Chr2:16595587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A14,A18,B11,B124,B60,B63,B66,B74,B88,C17,C55,C60,C61,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790946.1

254 aa

127

254

PIF1

Pif1_2B_dom

PF05970 PIF1 1-106 aa PF21530 Pif1_2B_dom 207-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790946.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	1	106	1.8e-38	133.1	PIF1-like helicase
`XP_057790946.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	207	248	2.6e-16	59.8	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934963.1
ATGACACATAGATACTGTTTTGAAGCGCTTGATAGAAGCTTAAGGGATATTATGAGATCTTCCGATAGGTCTGGAAAACCTTTTGGAGGTTTGGTGGATGTTTTAGGAGGCGTCTTTCGACAGATACTTCCAGTGATCCCTAAGGGAAGTCGGCATGATATCGTGCATGCCTCTATAAGTTCATCTCAACTTTGGAATTCGTGTCAAGTTCTCAAGTTAACTAAGAACATGAGATTACAGGCAAATGCTTCTGGTTCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008062
ATGACACATAGATACTGTTTTGAAGCGCTTGATAGAAGCTTAAGGGATATTATGAGATCTTCCGATAGGTCTGGAAAACCTTTTGGAGGTTTGGTGGATGTTTTAGGAGGCGTCTTTCGACAGATACTTCCAGTGATCCCTAAGGGAAGTCGGCATGATATCGTGCATGCCTCTATAAGTTCATCTCAACTTTGGAATTCGTGTCAAGTTCTCAAGTTAACTAAGAACATGAGATTACAGGCAAATGCTTCTGGTTCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790946.1
MTHRYCFEALDRSLRDIMRSSDRSGKPFGGLVDVLGGVFRQILPVIPKGSRHDIVHASISSSQLWNSCQVLKLTKNMRLQANASGSDVEETKEFAEWILKIGDGTAGHNLGDGESVVALSEDILIRDAINPIAAIVENTYNDVMNNAFDPEMFKNRAILAPTNEIVDTINDYVMSLMSTKERVYLSSDSICKEDGQMDLDEQVFSVEYLNTIRCSGLPSYEIKLKEGCIIMLLRNIDPSNELCNGTRLADSNST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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