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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000956`

染色体: Chr02 坐标: 16605244-16608137 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000956`
名称	SmilChr02G000956
描述	exonuclease V, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	16605244 - 16608137 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011393`
GeneID	`131011393`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011393`
原始查询	`SmilChr02G000956`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	exonuclease V, chloroplastic-like
产物	exonuclease V%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G60370` (AT5G60370) exonuclease V-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836159] identity=40; qcov=0.897; evalue=1.17e-24; confidence=medium
Rice	`Os05g0123300` - identity=50.5; qcov=0.812; evalue=3.29e-25; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0036297 (interstrand cross-link repair); GO:0045145 (single-stranded DNA 5'-3' DNA exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF09810 (Exo5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011393

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795186.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795186.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795186.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795186.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795186.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:16607119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B1,B110,B2,B24,B78,B93,C23
`Chr2:16607129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A7,B106,B118,B25,B31,B4,B48,B51,B64,B67,B98,C14,C57,C58,C76,C78,C87,D2,D3,D4,D6
`Chr2:16607151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C15
`Chr2:16607172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:16607195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A2,B108,B57,C23,C55
`Chr2:16607195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B108,B57,C23,C55
`Chr2:16607649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,D7
`Chr2:16607663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:16607664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr2:16607683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C41
`Chr2:16607698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B79,C77,D7
`Chr2:16607700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B79,C77,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795186.1

117 aa

117

Exo5

PF09810 Exo5 23-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795186.1`	Pfam	`PF09810`	Exo5	Family	23	91	2e-08	34.9	Exonuclease V - a 5' deoxyribonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096886.1
CAACTCTCTCAACCCGCCGCAATTCAATTCATCTTCCCCTTTCTCTCACATCCGACTCTCCTATCCCCACCTCAATTCGCCGTACTGGTCACCTCCATCATCGCCTTCGACTGACTCCCGCACACAACACAGTCCGCCGCCTTCCTCGGGGACGGCGAAATCGCCGCTCCTCCCTCTCTTTCATGCAATCCGCCCACTCCTCCCTTCCTGCAGTTCCCGACAAGTAACGGTGAAGACCGCCACCGTCGTCTCAATCCCCG...

XM_057939203.1
GTCACCATAATTTTCCATTCTTAATGTTAAAATTGGTCAAATGTGAAAAGTTTCCAGCTTTATTGAGCATGTTTATTGTGTGGATTTTGGCAATTGATGTATGCTATTGGAATGGATCATATTGAAATCTGCCATTAAAATATGTTCTGGGTTCTGATTTTGGCGATTGATGTGTGCTATTGGAATGAATCATTTTTAAATATGCTATTAAAATATGTTCTGAGTTATGATTTTGGCGATTGATGTATGCTATTGGTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011393
ATGTGGTTGTTTATGCAGACTCTGAGCGACGTGGTACGGTATTTTGAAAATAGTTGCTGCTCGCTGCCTATGACTCATGACCAGCTATTGTTGAGATACGAGTTACAGGAAGATCATTCCTTATTAGGGGAAGATGAATTTGAGTATGACTATGATCTGGTCAAGGTTCAAATGAAGTTATGTCTCGAGTTTTGGTTGGGCAATAGAGAAGCCAGTTACCCTCCTATGGAGGAGCTCTGGAAATGCAAGTTCTACAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795186.1
MWLFMQTLSDVVRYFENSCCSLPMTHDQLLLRYELQEDHSLLGEDEFEYDYDLVKVQMKLCLEFWLGNREASYPPMEELWKCKFYKFASVCPINSDPDDSPSKTKSEDIPSPDPTPK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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