当前解析结果
SmilChr02G000959| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000959 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000959 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000959 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 16699681 - 16700841 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008064 |
|---|---|
| GeneID | 131008064 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008064 |
| 原始查询 | SmilChr02G000959 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=28.3; qcov=0.687; evalue=7.91e-25; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008064 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057790948.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057790948.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057790948.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790948.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790948.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:16699689 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr2:16699690 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,B117,C57 |
Chr2:16699707 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | A4,A8,B39 |
Chr2:16699707 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A4,A8,B39 |
Chr2:16699708 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,B11,B28,C42 |
Chr2:16699721 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A18,B24,C14,C20,C24,C74 |
Chr2:16699723 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B65,C72,C9 |
Chr2:16699726 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A24,C10,C18 |
Chr2:16699741 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,C46,C68,C79 |
Chr2:16699743 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B77,C28,C61 |
Chr2:16699747 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B118,B140,C10,C18,C62 |
Chr2:16699747 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B118,B140,C10,C18,C62 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。