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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000967`

染色体: Chr02 坐标: 16885478-16888645 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000967`
名称	SmilChr02G000967
描述	uncharacterized SmilChr02G000967
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	16885478 - 16888645 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008067`
GeneID	`131008067`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008067`
原始查询	`SmilChr02G000967`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0656500` - identity=26.7; qcov=0.287; evalue=8.45e-29; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF13976 (gag_pre-integrs); PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008067

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790951.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057790951.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790951.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790951.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790951.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:16885531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B107,B24,C11,C2,C41,C44,C69
`Chr2:16885547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B17,B5,B65,B86
`Chr2:16885558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C35,C76
`Chr2:16885560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B88
`Chr2:16885574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B68,C41
`Chr2:16885582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A22,B103,B119,B6,B7,B78
`Chr2:16885591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B82,C13,C15,C17
`Chr2:16885596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B62,C78,C84
`Chr2:16885600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B90,C15,C59
`Chr2:16885614`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	B118,B126,B129,B133,B42,B54,B62,B75,B90,C15,C45,C53,C55,C60,C8,D2
`Chr2:16885621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B88,B92,B98,C78
`Chr2:16885634`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	84	A2,A23,A3,A6,A7,A8,B100,B101,B105,B106,B112,B113,B114,B117,B118,B123,B125,B128,B129,B130,B131,B133,B134,B137,B140,B22,B25,B29,B31,B32,B34,B39,B4,B40,B42,B46,B52,B53,B54,B67,B68,B71,B75,B79,B80,B83,B85,B88,B9,B90,B92,B97,C15,C18,C2,C21,C24,C25,C26,C29,C3,C33,C40,C41,C46,C49,C50,C51,C53,C58,C6,C60,C64,C65,C66,C72,C78,C8,C80,C84,C86,D11,D2,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790951.1

1055 aa

528

1055

Retrotran_gag_2

gag_pre-integrs

PF14223 Retrotran_gag_2 67-210 aa PF13976 gag_pre-integrs 730-790 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790951.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	67	210	4.1e-22	79.4	gag-polypeptide of LTR copia-type
`XP_057790951.1`	Pfam	`PF13976`	gag_pre-integrs	Domain	730	790	9.6e-13	48.4	GAG-pre-integrase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934968.1
ATGGATGTGTCTAATGCTTCGGTTCGTCCTCCTATATTGGATAGTAGTGGGAAGAACTATTCCTTGTGGAAAACTAGGATGACGATGTACATAAAATCCATTGATGAACGTGCCTGGGTTGTTGTGTTGGATGGATGGACTCCACCGCGTGTTACTGATGATGTTGGCAACATTACTCCTAAACCAGAAAGTCAATGGAGTGCAGATGAACGACTCATTTCCAGTCACAACTCCAGGGCTTTGAAGGCTATTTTCATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008067
ATGGATGTGTCTAATGCTTCGGTTCGTCCTCCTATATTGGATAGTAGTGGGAAGAACTATTCCTTGTGGAAAACTAGGATGACGATGTACATAAAATCCATTGATGAACGTGCCTGGGTTGTTGTGTTGGATGGATGGACTCCACCGCGTGTTACTGATGATGTTGGCAACATTACTCCTAAACCAGAAAGTCAATGGAGTGCAGATGAACGACTCATTTCCAGTCACAACTCCAGGGCTTTGAAGGCTATTTTCATCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790951.1
MDVSNASVRPPILDSSGKNYSLWKTRMTMYIKSIDERAWVVVLDGWTPPRVTDDVGNITPKPESQWSADERLISSHNSRALKAIFISVDVPCFRMISNCVEARDAWFILQEKCEGLTSVRVTKLRMLTTKFEIFRMHEDETILTYYEKLCEISNEAVDLEEPINNKRLVSKMLRSLPERYNMKISSIEETADVTSIRIGDLVSMLVAFETNLEQQKPGYYPKNVVFHVDKSASTIDVTDNVESADVDLEDDDDVNLVMLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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