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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000980`

染色体: Chr02 坐标: 17177608-17183859 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000980`
名称	SmilChr02G000980
描述	chloride channel protein CLC-f
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	17177608 - 17183859 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011410`
GeneID	`131011410`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011410`
原始查询	`SmilChr02G000980`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chloride channel protein CLC-f
产物	chloride channel protein CLC-f
Arabidopsis	`AT1G55620` (CLC-F) chloride channel F [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842011] identity=65.4; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0499200` (OsCBSCLC8) - identity=68; qcov=0.95; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005247 (voltage-gated chloride channel activity); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006821 (chloride transport); GO:0009507 (chloroplast); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00571 (CBS); PF00654 (Voltage_CLC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011410

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057795204.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057795204.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057795204.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795204.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795204.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:17177773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B64
`Chr2:17177905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B49,B60,B79
`Chr2:17177933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C72
`Chr2:17177941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C74
`Chr2:17177950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:17177966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:17179246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr2:17179838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B108,B113,B31,C52
`Chr2:17179854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B79
`Chr2:17179858`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B79
`Chr2:17179858`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B79
`Chr2:17179859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795204.1

764 aa

382

764

Voltage_CLC

CBS

PF00654 Voltage_CLC 176-516 aa PF00571 CBS 586-640 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795204.1`	Pfam	`PF00654`	Voltage_CLC	Family	176	516	2.1e-71	241.6	Voltage gated chloride channel
`XP_057795204.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	586	640	1e-13	52.1	CBS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096905.1
AAAGTTAAAAAAGAGGCATTGACAAAACATAACGTGAAAAGGGTCAAAATCTCTGAACCCCGAGCGATGGAGGGGTGGTATCTTTATTAAGGGTCGGAGGAGAGCGGAGGTGATCTCGAGATATGTCGTCGGCCGCTGACTACAACGATCGCGCCATTCTATTGCGCTCCAATTCGTTGGGCTCCGACGACGATCTGGAGCACGGCGCCGCTCATTCCCCCAAAACCAGCAGCAAGGGGGGCGGCCTCGCCTCCGATCTC...

XM_057939221.1
AAAGTTAAAAAAGAGGCATTGACAAAACATAACGTGAAAAGGGTCAAAATCTCTGAACCCCGAGCGATGGAGGGGTGGTATCTTTATTAAGGGTCGGAGGAGAGCGGAGGTGATCTCGAGATATGTCGTCGGCCGCTGACTACAACGATCGCGCCATTCTATTGCGCTCCAATTCGTTGGGCTCCGACGACGATCTGGAGCACGGCGCCGCTCATTCCCCCAAAACCAGCAGCAAGGGGGGCGGCCTCGCCTCCGATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011410
ATGTCGTCGGCCGCTGACTACAACGATCGCGCCATTCTATTGCGCTCCAATTCGTTGGGCTCCGACGACGATCTGGAGCACGGCGCCGCTCATTCCCCCAAAACCAGCAGCAAGGGGGGCGGCCTCGCCTCCGATCTCTTGAAGCGCCTCGATCGCGGCCTTACCGCTTCCGGCCGCCGATTGAGCGTCCACCACCGCATTTCCTCTTCTTCCCCCTCCTCTCCCTCCTCTGATCACCCTAATGCCGCCGCCACCGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795204.1
MSSAADYNDRAILLRSNSLGSDDDLEHGAAHSPKTSSKGGGLASDLLKRLDRGLTASGRRLSVHHRISSSSPSSPSSDHPNAAATADDSLADGAPPEWALLLIGCLLGVATGLCVASFNRGVHVIHEWAWAGTPNEGAAWLRIQRLADTWHRILLIPVLGGVIVGVLHGLLEILSQIKQSTSSQGQGLDVLAAIFPILKAVQAGVTLGTGCSLGPEGPSVDIGKSCANGFSVMMENNRERKIALVAAGAAAGIASGFNAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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