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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000986`

染色体: Chr02 坐标: 17344058-17346016 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000986`
名称	SmilChr02G000986
描述	GRAS family protein RAD1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	17344058 - 17346016 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011414`
GeneID	`131011414`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011414`
原始查询	`SmilChr02G000986`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GRAS family protein RAD1-like
产物	GRAS family protein RAD1-like
Arabidopsis	`AT1G66350` (RGL1) RGA-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842953] identity=35.5; qcov=0.815; evalue=3.79e-74; confidence=medium
Rice	`Os03g0707600` (SLR1) - identity=35.4; qcov=0.823; evalue=5.27e-66; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011414

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795207.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795207.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795207.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795207.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795207.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:17344385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B72,B83,C36
`Chr2:17344442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr2:17344490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:17344633`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A10,B29,B31,B65,B67,B74,B89,C6
`Chr2:17344967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:17345012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B42,B43,C50
`Chr2:17345042`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B95
`Chr2:17345042`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B95
`Chr2:17345045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:17345209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B135
`Chr2:17345402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C32,C68
`Chr2:17345477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795207.1

498 aa

249

498

GRAS

PF03514 GRAS 114-483 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795207.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	114	483	1.2e-102	344.4	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939224.1
TGTAATAATAAATGCCATACTAACAATAATGCAATAATTAAACAATATGAATTGAATAAATACCACTCCACGTATAGACTATTGTGATTCGAAGAAACCTAAATAGTCTTGGCAATTGTTTTATGACACAATCAAAAATCTTCCGAAAGAAGGTTAATATCCTTCCCTAACTAAGACATACATATTAACTTGCTCCAACCATTCATCTCTCACTCTCCAAATTCCCACAAAAATCCCAAAGCAGCCGGAACTCATAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011414
ATGAACGGATGGGTCGCGGCCGTCACACACCAAGACTCCGCCATCCGTCAGTTCTGCGCCGCGCGCATGGAGGAGCAAGAACAAGGCAGAGAATGGGAGCACGACGACCTCGGCCTCCACGAGATATGGTCGTCTCTCGATTTCACCAACGACACGCCGCCACTCGATGTCGACCAATTCGTCGACACTTTCTTCAACGCCGAATACTACGACAACGATCACCTCCAACAACAACAACTTTCAAATATAGACGACGATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795207.1
MNGWVAAVTHQDSAIRQFCAARMEEQEQGREWEHDDLGLHEIWSSLDFTNDTPPLDVDQFVDTFFNAEYYDNDHLQQQQLSNIDDDGRVYVEANTATMMNVAANVNGVDEGLQLVHLLLACAEAVGCRDAQLAHSILNQIWPCVNPWGDSLQRVSHCFAMGLKSRLSLLQNVNPNGSFSSNNIDASTITREERNEAFALLHKTTPYIAFGFVAANDAICQAAKGEESLHIIDLGMEHNLQWPSMVKTLSTRPEGPPKHVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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